RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 ARMS2P0C7Q2 107 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 ARL14EPLP0DKL9 152 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 S100A4P26447 101 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 RPL19P84098 196 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 PQLC2Q6ZP29 291 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 SPACA4Q8TDM5 124 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 IL36BQ9NZH7 164 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 C5orf17Q8NAS9 161 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 SFRP2Q96HF1 295 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 HSPB11Q9Y547 144 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 A0A0J9YXV3 536 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 PRR34Q9NV39 138 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 M0R036 132 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 RHODO00212 210 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 CNBPP62633 177 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 KCNIP4Q6PIL6 250 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 SUN5Q8TC36 379 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 PLAC8Q9NZF1 115 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 EPDR1Q9UM22 224 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRS-208ENST00000590509 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1W2PPV4 95 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 KRBOX1C9JBD0 128 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 PTTG1O95997 202 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 MIAQ16674 131 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 LINC00269Q8N2A0 174 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 DPH3Q96FX2 82 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 DPH3P1Q9H4G8 78 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 BATF3Q9NR55 127 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 B4DEV8 164 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 M0R381 172 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 STAG3L2P0CL84 134 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 STAG3L3P0CL85 134 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 GCHFRP30047 84 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 H2BFSP57053 126 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 RBX1P62877 108 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 PRR3P79522 188 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 ZFP69Q49AA0 526 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 DNLZQ5SXM8 178 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 OR11H4Q8NGC9 324 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 OR10G8Q8NGN5 311 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 SCGB1C1Q8TD33 95 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa10□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 FABP5P3A8MUU1 101 aa10□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 GAGE6Q13070 117 aa10□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 WDR73Q6P4I2 378 aa10□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa10□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 CHCHD5Q9BSY4 110 aa10□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 hDV102S1A0JD36 115 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 SH2D1AO60880 128 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 RAB24Q969Q5 203 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 RNF185Q96GF1 192 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 MUC2Q02817 5179 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 RPL12P30050 165 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 RAB5CP51148 216 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 PRR27Q6MZM9 219 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 GTSF1Q8WW33 167 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRS-208ENST00000590509 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 K7EQM0 130 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 MPC2O95563 127 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 COX6A2Q02221 97 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 Q86TA4 180 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 LYPD6BQ8NI32 183 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 DEFA3P59666 94 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 REG3AQ06141 175 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 C7orf33Q8WU49 177 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 TPT1P13693 172 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF56Q15929 161 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 MAJINQ3KP22 176 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 C15orf56Q8N910 161 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 RAB4BP61018 213 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 ZFP82Q8N141 532 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 OR10AG1Q8NH19 301 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 VAX2Q9UIW0 290 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 UBE2G2P60604 165 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 LINC01559Q495D7 138 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRS-208ENST00000590509 STPG4Q8N801 248 aa9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms