RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589864.1

TNNI3-208, Transcript of troponin I3, cardiac type, human

TSL 2

Gene TNNI3, Length 525 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNI3-208	ENST00000589864	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TNNI3-208	ENST00000589864	SUN5	Q8TC36	379 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TNNI3-208	ENST00000589864	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TNNI3-208	ENST00000589864	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TNNI3-208	ENST00000589864	MIA	Q16674	131 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TNNI3-208	ENST00000589864	SFRP2	Q96HF1	295 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TNNI3-208	ENST00000589864	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TNNI3-208	ENST00000589864	LRP2	P98164	4655 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TNNI3-208	ENST00000589864		A0A087WWL8	130 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TNNI3-208	ENST00000589864	STAG3L2	P0CL84	134 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TNNI3-208	ENST00000589864	STAG3L3	P0CL85	134 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TNNI3-208	ENST00000589864	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TNNI3-208	ENST00000589864	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TNNI3-208	ENST00000589864	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TNNI3-208	ENST00000589864	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TNNI3-208	ENST00000589864		B4DEV8	164 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864		H3BVH4	76 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	MPV17L2	Q567V2	206 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	CCDC32	Q9BV29	185 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	MPC2	O95563	127 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	PET100	P0DJ07	73 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	GCHFR	P30047	84 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	PKIA	P61925	76 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	DPH3	Q96FX2	82 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	RNF185	Q96GF1	192 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	WFDC1	Q9HC57	220 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	H2BFS	P57053	126 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	LINC01600	Q96MT4	127 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	PRR34	Q9NV39	138 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	RAB24	Q969Q5	203 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864		A0A087WYN8	130 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864		M0R381	172 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	PTTG1	O95997	202 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	CXorf1	O96002	111 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
TNNI3-208	ENST00000589864	TNXB	P22105	4242 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864		A0A1W2PRE2	83 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864		M0R036	132 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	CRIP1	P50238	77 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	RAB4B	P61018	213 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	ZFP82	Q8N141	532 aa		10.39	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		10.38	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		10.38	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		10.38	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		10.38	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		10.38	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	hDV102S1	A0JD36	115 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	MB	P02144	154 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	RBX1	P62877	108 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	PRR27	Q6MZM9	219 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864		Q86TA4	180 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	C7orf33	Q8WU49	177 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	PHOX2A	O14813	284 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	SH2D1A	O60880	128 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	IFNA7	P01567	189 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	SERF2	P84101	59 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	ENKUR	Q8TC29	256 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	CHTF8	P0CG12	524 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	LINC01559	Q495D7	138 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	VAX2	Q9UIW0	290 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864		A0A0J9YXV3	536 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	PEX7	O00628	323 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	SLPI	P03973	132 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	ATP6V0C	P27449	155 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	KRTAP10-8	P60410	259 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	ODF1	Q14990	250 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF56	Q15929	161 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TNNI3-208	ENST00000589864	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TNNI3-208	ENST00000589864	GAS8-AS1	O95177	125 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TNNI3-208	ENST00000589864		P01737	135 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TNNI3-208	ENST00000589864	REG3A	Q06141	175 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TNNI3-208	ENST00000589864	WDR73	Q6P4I2	378 aa		10.33	□□□□□ -0.76

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