RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 K7EN84 100 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 PSPHP1O15172 72 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 PFN1P07737 140 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 PTHLHP12272 177 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 AKR1C4P17516 323 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 PRSS3P35030 304 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 TERB2Q8NHR7 220 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 ENKURQ8TC29 256 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00167Q96N53 147 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 SLC50A1Q9BRV3 221 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 DUSP21Q9H596 190 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 NDUFB11Q9NX14 153 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 FUT9Q9Y231 359 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 RBFOX3A6NFN3 312 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 TNFAIP8O95379 198 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 PMP2P02689 132 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 NMBP08949 121 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 PSMB2P49721 201 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 GUK1Q16774 197 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 NMSQ5H8A3 153 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 LCN15Q6UWW0 184 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 BAP18Q8IXM2 172 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 TREM1Q9NP99 234 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 SLC39A9Q9NUM3 307 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 VAX2Q9UIW0 290 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 FAT1Q14517 4588 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 CDS2O95674 445 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 SULT1A3P0DMM9 295 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 SULT1A4P0DMN0 295 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 CRYBA4P53673 196 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 PIGPP57054 158 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 SCXQ7RTU7 201 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 ANAPC10Q9UM13 185 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 PXMP4Q9Y6I8 212 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-208ENST00000578600 GGTLC3B5MD39 225 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 SPINK4O60575 86 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 HYPMO75409 117 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 IGKV1-39P01597 117 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 IGKV1-5P01602 117 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 IGKV1D-39P04432 117 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 ORM2P19652 201 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 CXCL3P19876 107 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 TCL1AP56279 114 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 RAB31Q13636 194 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 ELOBQ15370 118 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 SPINK9Q5DT21 86 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 UBE2NLQ5JXB2 153 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 Q6ZTI0 123 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 C2orf50Q96LR7 162 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00477Q96M19 166 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 VCX3BQ9H321 246 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 HIGD1AQ9Y241 93 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 A0A087WWC5 75 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 TCAPO15273 167 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 HLA-DMAP28067 261 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRM-208ENST00000578600 ZNF90Q03938 601 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRM-208ENST00000578600 OR10J3Q5JRS4 329 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 Q5W150 140 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 DTD1Q8TEA8 209 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 PRADC1Q9BSG0 188 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 FXYD6Q9H0Q3 95 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 PRELID1Q9Y255 219 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 C7orf71A4D174 169 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-208ENST00000578600 NDUFS5O43920 106 aa3.25□□□□□ -1.89
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