RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRYGDP07320 174 aa23.03■■□□□ 1.28
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CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A087WWL8 130 aa23.03■■□□□ 1.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 COMMD7Q86VX2 200 aa23.03■■□□□ 1.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A29Q8N8R3 303 aa23.03■■□□□ 1.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALMS1Q8TCU4 4167 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00862A6NCI5 91 aa23.01■■□□□ 1.27
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CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR73Q6P4I2 378 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSKUQ8WUA8 353 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNFNQ9BYD5 112 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 V9GYV3 84 aa23.01■■□□□ 1.27
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RHOHQ15669 191 aa23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10G8Q8NGN5 311 aa23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 AP1S3Q96PC3 154 aa23■■□□□ 1.27
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GFRA4Q9GZZ7 299 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM231BA6NCW3 169 aa22.98■■□□□ 1.27
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa22.98■■□□□ 1.27
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CCL18P55774 89 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZSN1 163 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 MSRB1Q9NZV6 116 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM218A2RU14 115 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SACSQ9NZJ4 4579 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa22.94■■□□□ 1.26
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TRGC1P0CF51 173 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEGR1Q7Z3B1 354 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 PGLYRP4Q96LB8 373 aa22.93■■□□□ 1.26
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAH1Q9P2D7 4330 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB4BP61018 213 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF56Q15929 161 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADCYAP1P18509 176 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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CTDNEP1-209ENST00000574205 BORCS7Q96B45 105 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00588Q9Y4M8 146 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 F8W036 122 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 SH2D6Q7Z4S9 175 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 EVI2AP22794 236 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAT8BQ9UHF3 227 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00315P59091 139 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEC11CQ9BY50 192 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 VPS13DQ5THJ4 4388 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 DPH3P1Q9H4G8 78 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GUT8 65 aa22.86■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP1R2P9O14990 202 aa22.86■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LYPD5Q6UWN5 251 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q9UF83 564 aa22.84■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SMIM15Q7Z3B0 74 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GAGE4Q13068 117 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAGE5Q13069 117 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAGE13Q4V321 117 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 UPK3BQ9BT76 320 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 MT-ND4LP03901 98 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00694P0DN24 101 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANAPC16Q96DE5 110 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 KMT2AQ03164 3969 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNRF2Q8NHG8 242 aa22.81■■□□□ 1.24
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa22.77■■□□□ 1.24
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C10orf91Q5T1B1 145 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 H7C1H1 209 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 SUMO4Q6EEV6 95 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 RYR3Q15413 4870 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0QY20 66 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 GTSF1LQ9H1H1 148 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q9H8V8 135 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM191AQ9H0A3 160 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2D3P61077 147 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2D2P62837 147 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GW15 77 aa22.7■■□□□ 1.22
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