RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 M0R036 132 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 UBE2D3P61077 147 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 UBE2D2P62837 147 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 SDIM1Q6ZPB5 146 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 OR11H4Q8NGC9 324 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 DPH3P1Q9H4G8 78 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 EPDR1Q9UM22 224 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 GRIFINA4D1Z8 144 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 ARMS2P0C7Q2 107 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 GCHFRP30047 84 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 RPL12P30050 165 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 FABP5P3A8MUU1 101 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 M0R381 172 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 STAG3L2P0CL84 134 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 STAG3L3P0CL85 134 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 H2BFSP57053 126 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 RPL19P84098 196 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 CYCSP99999 105 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 MPC2O95563 127 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 PTTG1O95997 202 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 MIAQ16674 131 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 DPH3Q96FX2 82 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 SFRP2Q96HF1 295 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC40-211ENST00000574099 CHTF8P0CG12 524 aa11.14□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 MZT2BQ6NZ67 158 aa11.14□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 RAB24Q969Q5 203 aa11.14□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 KRBOX1C9JBD0 128 aa11.13□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 PET100P0DJ07 73 aa11.13□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 SUN5Q8TC36 379 aa11.13□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC32Q9BV29 185 aa11.13□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 A0A087WYN8 130 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 TPT1P13693 172 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 Q86TA4 180 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 PHOX2AO14813 284 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 SH2D1AO60880 128 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 CRIP1P50238 77 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 DNLZQ5SXM8 178 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 ENKURQ8TC29 256 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 hDV102S1A0JD36 115 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF56Q15929 161 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 ZFP82Q8N141 532 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 LINC00269Q8N2A0 174 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 OR10G8Q8NGN5 311 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM167BQ9NRX6 74 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 IFNA7P01567 189 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 GAGE6Q13070 117 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 LINC01600Q96MT4 127 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 PRR34Q9NV39 138 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 CXorf1O96002 111 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 PKIAP61925 76 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 CNBPP62633 177 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 RBX1P62877 108 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 CLRN3Q8NCR9 226 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 SPACA4Q8TDM5 124 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 PEX7O00628 323 aa11.07□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 GAS8-AS1O95177 125 aa11.07□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 UBE2G2P60604 165 aa11.07□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa11.07□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 C7orf33Q8WU49 177 aa11.07□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 RNF185Q96GF1 192 aa11.07□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 SSNA1O43805 119 aa11.06□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 FAM162BQ5T6X4 162 aa11.06□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 A0A1W2PRE2 83 aa11.05□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa11.05□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 SLPIP03973 132 aa11.05□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 ATP6V0CP27449 155 aa11.05□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 RAB4BP61018 213 aa11.05□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 AP5S1Q9NUS5 200 aa11.05□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 LINC01559Q495D7 138 aa11.04□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 PRR27Q6MZM9 219 aa11.04□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 GTSF1Q8WW33 167 aa11.04□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 PLAC8Q9NZF1 115 aa11.04□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 RAB5CP51148 216 aa11.03□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 DEFA3P59666 94 aa11.03□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 PRR3P79522 188 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 REG3AQ06141 175 aa11.03□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 WDR73Q6P4I2 378 aa11.03□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 DERL1Q9BUN8 251 aa11.03□□□□□ -0.64
CCDC40-211ENST00000574099 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms