RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569899.5

GDE1-205, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 4

Gene GDE1, Length 1,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-205ENST00000569899 S100A8P05109 93 aa7.21□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.21□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.21□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.21□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 IL17DQ8TAD2 202 aa7.21□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.21□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 APCSP02743 223 aa7.2□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.2□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 AMN1Q8IY45 258 aa7.2□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 HIST1H2BKO60814 126 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 HIST1H2BJP06899 126 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 TRGC1P0CF51 173 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 EVI2AP22794 236 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 HIST1H2BOP23527 126 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 HIST1H2BBP33778 126 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 HIST1H2BDP58876 126 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 KRTAP10-2P60368 255 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 RAB5BP61020 215 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 HIST1H2BCP62807 126 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 AP1S3Q96PC3 154 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 RCHY1Q96PM5 261 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 JPT2Q9H910 190 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 A8MZ25 164 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 RRN3P1Q2M238 152 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 C16orf74Q96GX8 76 aa7.19□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.18□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 SRIP30626 198 aa7.18□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.18□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 ZNF876PQ49A33 203 aa7.18□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.18□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 RNF185Q96GF1 192 aa7.18□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 M0R2P5 195 aa7.17□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 NCR2O95944 276 aa7.17□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 MGPP08493 103 aa7.17□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.17□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 SPXQ9BT56 116 aa7.17□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 DNHD1Q96M86 4753 aa7.17□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 A0A087WWL8 130 aa7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 SMKR1H3BMG3 65 aa7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 K7EIL1 84 aa7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 UBE2CO00762 179 aa7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 RAB4AP20338 218 aa7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 RETNQ9HD89 108 aa7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 D6R8Y8 96 aa7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 GAS8-AS1O95177 125 aa7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 Q6ZTI0 123 aa7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 Q6ZWC4 215 aa7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 OR11H2Q8NH07 326 aa7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 RNF183Q96D59 192 aa7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.16□□□□□ -1.26
GDE1-205ENST00000569899 EMP1P54849 157 aa7.15□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 LINC00315P59091 139 aa7.15□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 IQCJQ1A5X6 159 aa7.15□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 PTH2Q96A98 100 aa7.15□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.15□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.14□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.14□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 CRYGDP07320 174 aa7.14□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 SMIM17P0DL12 118 aa7.14□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 NDUFA6P56556 154 aa7.14□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 Q8NAQ8 132 aa7.14□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.14□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 U3KQK5 164 aa7.14□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.13□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.13□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.13□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 DEFB4AO15263 64 aa7.13□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 NPYP01303 97 aa7.13□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 GCSHP23434 173 aa7.13□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 CKS2P33552 79 aa7.13□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 ZNF56Q15929 161 aa7.13□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.13□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.13□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 ORMDL3Q8N138 153 aa7.13□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 RASL10AQ92737 203 aa7.13□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 PRELID3AQ96N28 172 aa7.13□□□□□ -1.27
GDE1-205ENST00000569899 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms