RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	EPDR1	Q9UM22	224 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	PRSS1	P07477	247 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	STAG3L2	P0CL84	134 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	STAG3L3	P0CL85	134 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	GCHFR	P30047	84 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169		H3BVH4	76 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	PANO1	I0J062	215 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	UBE2D3	P61077	147 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	UBE2D2	P62837	147 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	RAB24	Q969Q5	203 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169		A0A087WWL8	130 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM262	E9PQX1	116 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	PET100	P0DJ07	73 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	SFRP2	Q96HF1	295 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169		A0A0D9SG52	128 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169		B4DEV8	164 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	HLA-DQA1	P01909	254 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	CRP	P02741	224 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	MIA	Q16674	131 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	MPV17L2	Q567V2	206 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	CRIP1	P50238	77 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	ENKUR	Q8TC29	256 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169		A0A1W2PRE2	83 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169		M0R036	132 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	CXorf1	O96002	111 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	PRR34	Q9NV39	138 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169		M0R381	172 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	SH2D1A	O60880	128 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	PTTG1	O95997	202 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169		Q86TA4	180 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	ZFP82	Q8N141	532 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	MB	P02144	154 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	ATP6V0C	P27449	155 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	PKIA	P61925	76 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	SERF2	P84101	59 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	PRR27	Q6MZM9	219 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169		A0A087WYN8	130 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	PEX7	O00628	323 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	SSNA1	O43805	119 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	IFNA7	P01567	189 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	RAB4B	P61018	213 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	RNF185	Q96GF1	192 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	LRP2	P98164	4655 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TCF4-238	ENST00000568169	UPK1B	O75841	260 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TCF4-238	ENST00000568169	RBX1	P62877	108 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TCF4-238	ENST00000568169	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TCF4-238	ENST00000568169	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TCF4-238	ENST00000568169	S100Z	Q8WXG8	99 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TCF4-238	ENST00000568169	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TCF4-238	ENST00000568169	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TCF4-238	ENST00000568169	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		7.2	□□□□□ -1.26
TCF4-238	ENST00000568169	CHTF8	P0CG12	524 aa		7.2	□□□□□ -1.26

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