RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 V9GYV3 84 aa4.96□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 MUC4Q99102 2169 aa4.96□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.95□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1B0GV90 55 aa4.95□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 NBEAP1P0C6P0 100 aa4.95□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCL1AP56279 114 aa4.95□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.95□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 BAGE3Q86Y29 109 aa4.95□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 BAGE2Q86Y30 109 aa4.95□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 FXYD5Q96DB9 178 aa4.95□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.95□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC00477Q96M19 166 aa4.95□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 C8orf49Q96NF6 230 aa4.95□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q9H3A6 140 aa4.95□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 GRIFINA4D1Z8 144 aa4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 GGTLC3B5MD39 225 aa4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 PAX4O43316 350 aa4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 NUPR1O60356 82 aa4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPINK4O60575 86 aa4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 SERF1AO75920 110 aa4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 MGST1P10620 155 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF138P52744 262 aa4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC00315P59091 139 aa4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF415Q09FC8 603 aa4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 SAMD10Q9BYL1 202 aa4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF492Q9P255 531 aa4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 ICOSQ9Y6W8 199 aa4.94□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 H3BNG1 76 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 PEX7O00628 323 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 NXPH4O95158 308 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGLV2-8P01709 118 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 HLA-DQA1P01909 254 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 CSN1S1P47710 185 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP10-2P60368 255 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM183BQ1AE95 376 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 RASL11AQ6T310 242 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 UPK3BQ9BT76 320 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 PKHD1P08F94 4074 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 M0R143 59 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 SIVA1O15304 175 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 APCSP02743 223 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC00310P59036 64 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 GNG5P63218 68 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMIM12Q96EX1 92 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF479Q96JC4 524 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCNS1Q96KK3 526 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 VAMP8Q9BV40 100 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 MDFICQ9P1T7 246 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRO0255Q9UI72 69 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBAKDNA6NC62 111 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 PGPA6NDG6 321 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 DIRC3C9JPN6 131 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 F2Z2F3 143 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 EREGO14944 169 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDK2AP2O75956 126 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 CRYBA4P53673 196 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBE2G1P62253 170 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 FHL2Q14192 279 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM159AQ6UWV7 190 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 SGK494Q96LW2 274 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 C18orf15Q96N68 181 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 EPDR1Q9UM22 224 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNAH2Q9P225 4427 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.9□□□□□ -1.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.9□□□□□ -1.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCAPO15273 167 aa4.9□□□□□ -1.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 GNRH2O43555 120 aa4.9□□□□□ -1.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 GYPEP15421 78 aa4.9□□□□□ -1.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAB4AP20338 218 aa4.9□□□□□ -1.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 SRIP30626 198 aa4.9□□□□□ -1.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 AMTP48728 403 aa4.9□□□□□ -1.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTDAPP60985 99 aa4.9□□□□□ -1.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms