RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL20	P78556	96 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	GAGE12J	A6NER3	117 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	RHOD	O00212	210 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	GAGE1	Q13065	139 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	GAGE4	Q13068	117 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	GAGE5	Q13069	117 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	GAGE13	Q4V321	117 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	BAGE2	Q86Y30	109 aa		14.63	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	EREG	O14944	169 aa		14.62	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	14.62	□□□□□ -0.07	3e-6	■□□□□ 10.8
PPP4C-205	ENST00000563200		M0R381	172 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB5C	P51148	216 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		14.61	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A087WWL8	130 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	CXCL1	P09341	107 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	FAT1	Q14517	4588 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFP82	Q8N141	532 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	C11orf52	Q96A22	123 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	S100A1	P23297	94 aa		14.59	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		14.59	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3-30	P01768	117 aa		14.58	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3-33	P01772	117 aa		14.58	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		14.58	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		14.58	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	DERL1	Q9BUN8	251 aa		14.58	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	GNG13	Q9P2W3	67 aa		14.58	□□□□□ -0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	SULT1A2	P50226	295 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8N3U1	123 aa		14.58	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	LAGE3	Q14657	143 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		14.57	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	SNAI2	O43623	268 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	C1QB	P02746	253 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A087WWC5	75 aa		14.55	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR27	Q6MZM9	219 aa		14.55	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8N1X5	172 aa		14.55	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		14.54	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5AL1	P0C617	328 aa		14.54	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200		Q9HAA7	133 aa		14.54	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV2-8	P01709	118 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC51B	Q86UW2	128 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX46	H3BTG2	121 aa		14.52	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PSCA	O43653	123 aa		14.52	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP10-1	P60331	282 aa		14.52	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CENPW	Q5EE01	88 aa		14.52	□□□□□ -0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2D3	P61077	147 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2D2	P62837	147 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB4B	P61018	213 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB19	A4D1S5	217 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	XG	P55808	180 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	NIT1	Q86X76	327 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	PDE6D	O43924	150 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM12	Q96EX1	92 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	BCL2	P10415	239 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8N814	137 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLC6	P0CF74	106 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	GNG4	P50150	75 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TM2D2	Q9BX73	214 aa		14.47	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNA1	P01562	189 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	GCSH	P23434	173 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF56	Q15929	161 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	14.46	□□□□□ -0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	GZMB	P10144	247 aa		14.45	□□□□□ -0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	TOR2A	Q5JU69	321 aa		14.45	□□□□□ -0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	MED9	Q9NWA0	146 aa		14.45	□□□□□ -0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	VAX2	Q9UIW0	290 aa		14.45	□□□□□ -0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	WFDC2	Q14508	124 aa		14.44	□□□□□ -0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		14.44	□□□□□ -0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		14.43	□□□□□ -0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		14.43	□□□□□ -0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	14.43	□□□□□ -0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	SST	P61278	116 aa		14.43	□□□□□ -0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		14.43	□□□□□ -0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		14.43	□□□□□ -0.1

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