RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 ABHD14BQ96IU4 210 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 C17orf77Q96MU5 243 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF580Q9UK33 172 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 STARD9Q9P2P6 4700 aa4.1□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 A0A0J9YXV3 536 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 RBAKDNA6NC62 111 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 A8MWL6 223 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 IGLL5B9A064 214 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 UMAD1C9J7I0 102 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 H3BUT2 72 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 COX7A2LO14548 114 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV4-59P01825 116 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 IL5P05113 134 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 CBLN1P23435 193 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 HBBP68871 147 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 PCP2Q8IVA1 136 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 DEFB107AQ8IZN7 70 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 C15orf53Q8NAA6 179 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 OR8A1Q8NGG7 326 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 LINC01006Q8NI28 216 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 PYGO2Q9BRQ0 406 aa4.09□□□□□ -1.75
TMOD3-209ENST00000561136 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 A0A0G2JRQ6 117 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 C9JQL5 133 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 C17orf112F2Z3M2 114 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 HMGN4O00479 90 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 SOCS2O14508 198 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 FSTL3O95633 263 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 FAUP35544 74 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 ETDBQ3ZM63 59 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 DOCK11Q5JSL3 2073 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 Q6ZSV7 163 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF329Q86UD4 541 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 ODF3L1Q8IXM7 274 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 C6orf223Q8N319 242 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 OR10G2Q8NGC3 310 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 OR5H2Q8NGV7 314 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 CMTM2Q8TAZ6 248 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 WFDC6Q9BQY6 131 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 SLC25A22Q9H936 323 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 STAB2Q8WWQ8 2551 aa4.08□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 CLPSL1A2RUU4 121 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 NAP1L6A6NFF2 107 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 SRRM5B3KS81 715 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 K7EIL1 84 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF737O75373 536 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 PPP1R3DO95685 299 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 CSN1S1P47710 185 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00313P59037 77 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 GNB2P62879 340 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 WFDC2Q14508 124 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 NMSQ5H8A3 153 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 LGALS9CQ6DKI2 356 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 PRNTQ86SH4 94 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00596Q86U02 117 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 ZNRF1Q8ND25 227 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 FAM213BQ8TBF2 198 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 AMELYQ99218 206 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 TIMM17AQ99595 171 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 RNF126Q9BV68 326 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 LYSTQ99698 3801 aa4.07□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00473A8K010 186 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 COX7A2P2O60397 106 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF253O75346 499 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 HLA-DQA1P01909 254 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 FGF12P61328 243 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM155Q4W5P6 130 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 ORMDL2Q53FV1 153 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 LYPD2Q6UXB3 125 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 Q6ZR03 302 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 AMN1Q8IY45 258 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF491Q8N8L2 437 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 ITLN1Q8WWA0 313 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-209ENST00000561136 TVP23CQ96ET8 276 aa4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms