RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 MT-ND6P03923 174 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 GPX1P07203 203 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 IGLC6P0CF74 106 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 SMIM6P0DI80 62 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 HOXA5P20719 270 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 CTRLP40313 264 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 DEFB1P60022 68 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 PRR9Q5T870 116 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 WDR73Q6P4I2 378 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 GATD1Q8NB37 220 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 C12orf57Q99622 126 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 C7orf71A4D174 169 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 F2Z2F3 143 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 Q9H8V8 135 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1B0GUT8 65 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 SNAI2O43623 268 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV3-20P01619 116 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 HLA-DQA1P01909 254 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 ORM1P02763 201 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 OR5AL1P0C617 328 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 FXYD7P58549 80 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 RRN3P1Q2M238 152 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZSN1 163 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 KCNS1Q96KK3 526 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 MDFICQ9P1T7 246 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 F5H768 121 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 XGP55808 180 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 TCL1AP56279 114 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 HBBP68871 147 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 RIGQ13278 110 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 BORCS7Q96B45 105 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 HIST1H2BKO60814 126 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 TRGC2P03986 189 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 HIST1H2BJP06899 126 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 GZMBP10144 247 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 HIST1H2BOP23527 126 aa6.47□□□□□ -1.37
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SMAD3-215ENST00000560424 HIST1H2BCP62807 126 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 KIR3DS1Q14943 382 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 SNURFLB1AK76 121 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 M0R2Z0 102 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 NXPH4O95158 308 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 TRGC1P0CF51 173 aa6.46□□□□□ -1.38
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SMAD3-215ENST00000560424 DEFB130AP0DP74 79 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 S100A2P29034 98 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 ASIPP42127 132 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 CACNG7P62955 275 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 FAT1Q14517 4588 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 ATP5G1P05496 136 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-215ENST00000560424 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.44□□□□□ -1.38
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