RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560207.1

RABGGTA-215, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-215ENST00000560207 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.44□□□□□ -1.06
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RABGGTA-215ENST00000560207 SEC11CQ9BY50 192 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-215ENST00000560207 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTA-215ENST00000560207 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.43□□□□□ -1.06
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RABGGTA-215ENST00000560207 NUDT3O95989 172 aa8.43□□□□□ -1.06
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RABGGTA-215ENST00000560207 F8W036 122 aa8.42□□□□□ -1.06
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RABGGTA-215ENST00000560207 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
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RABGGTA-215ENST00000560207 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.41□□□□□ -1.06
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RABGGTA-215ENST00000560207 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.35□□□□□ -1.07
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RABGGTA-215ENST00000560207 NIT2Q9NQR4 276 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTA-215ENST00000560207 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGGTA-215ENST00000560207 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTA-215ENST00000560207 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTA-215ENST00000560207 M0QY20 66 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTA-215ENST00000560207 SNAPINO95295 136 aa8.33□□□□□ -1.08
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