RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555743.1

PSMA3-208, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-208	ENST00000555743	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-208	ENST00000555743		M0R2N4	97 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-208	ENST00000555743	SIVA1	O15304	175 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-208	ENST00000555743	PAGE4	O60829	102 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-208	ENST00000555743	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-208	ENST00000555743	SRI	P30626	198 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-208	ENST00000555743	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-208	ENST00000555743	ASIP	P42127	132 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-208	ENST00000555743	SULT1A2	P50226	295 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-208	ENST00000555743	UBE2G1	P62253	170 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-208	ENST00000555743	RHOH	Q15669	191 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-208	ENST00000555743	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-208	ENST00000555743		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-208	ENST00000555743	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-208	ENST00000555743	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-208	ENST00000555743	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PSMA3-208	ENST00000555743	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743		B4DEV8	164 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	RHOD	O00212	210 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	PDE6D	O43924	150 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	SH2D1A	O60880	128 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	SFTA3	P0C7M3	94 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	GYPE	P15421	78 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	PARL	Q9H300	379 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	RYR1	P21817	5038 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	SNAI2	O43623	268 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	AKR1C3	P42330	323 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	CCL20	P78556	96 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743		A0A087WWC5	75 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	CRYGD	P07320	174 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	BCL2	P10415	239 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	LINC00315	P59091	139 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	LAGE3	Q14657	143 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	LELP1	Q5T871	98 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	HSPG2	P98160	4391 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743		H3BVH4	76 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	IFNA1	P01562	189 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	EVI2A	P22794	236 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743		Q8N1X5	172 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	MUC4	Q99102	2169 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743		M0R036	132 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	RAB4B	P61018	213 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743		F2Z2F3	143 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	GNG4	P50150	75 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	UBE2D3	P61077	147 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	UBE2D2	P62837	147 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSMA3-208	ENST00000555743	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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