RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.05□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 H3BUX3 64 aa7.05□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 SRD5A1P18405 259 aa7.05□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 MED13LQ71F56 2210 aa7.05□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.05□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.05□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.05□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 LGALS9O00182 355 aa7.05□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV3-30P01768 117 aa7.05□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.05□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF876PQ49A33 203 aa7.05□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.05□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.05□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV4-39P01824 125 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 SYT8Q8NBV8 401 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 MUC6Q6W4X9 2439 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 A6NDX4 124 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 J3QQQ9 107 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 Q6ZS46 218 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.04□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 K7EMT4 169 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 IGLV1-40P01703 118 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 CFC1BP0CG36 223 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 CFC1P0CG37 223 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF56Q15929 161 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 BLCAPP62952 87 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 RHOHQ15669 191 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 NFE4Q86UQ8 179 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 DCANP1Q8TF63 244 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.03□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 MUC4Q99102 2169 aa7.02□□□□□ -1.28
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 TCL1BO95988 128 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 TEN1Q86WV5 123 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 C9orf85Q96MD7 179 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 ODF3Q96PU9 254 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 VCX2Q9H322 139 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 A8MWV9 139 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 AMELXQ99217 191 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 NBASA2RRP1 2371 aa7.02□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 M0QY20 66 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 LEPROTO15243 131 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 EDN2P20800 178 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 CKS1BP61024 79 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 CDIP1Q9H305 208 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 ZFHX3Q15911 3703 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF688P0C7X2 276 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 PTH2Q96A98 100 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 MDFICQ9P1T7 246 aa7.01□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM223A0PJW6 202 aa7□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 CFHR3Q02985 330 aa7□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A0J9YX75 114 aa7□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 C19orf84I3L1E1 186 aa7□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 CRYBA4P53673 196 aa7□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 SBSPONQ8IVN8 264 aa7□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 Q8N1Y9 231 aa7□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 I3L3M4 83 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 TGFAP01135 160 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 IGKV3-20P01619 116 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 SPINK8P0C7L1 97 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 A4D1N5 150 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 CARD19Q96LW7 228 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 RHODO00212 210 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 FHL3Q13643 280 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 Q6ZUT4 128 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A0B4J2C4 111 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 RAX2Q96IS3 184 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 CCL19Q99731 98 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 ERG28Q9UKR5 140 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 ATRXP46100 2492 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV3-33P01772 117 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 688.3 ms