RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 ACYP1P07311 99 aa4.96□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 ADCYAP1P18509 176 aa4.96□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.96□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.96□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 Q9HAA7 133 aa4.96□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 A0A0J9YY99 117 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 F8W735 103 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 NPYP01303 97 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 hADV29S1A0JD25 119 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 SPRY2O43597 315 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 BLCAPP62952 87 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 A0A096LPF7 62 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 CTSGP08311 255 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 NDUFA1O15239 70 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 PYY3Q5JQD4 70 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 SIRPDQ9H106 197 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 NXPH4O95158 308 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 AMTNQ6UX39 209 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 Q6ZQT7 251 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 C17orf77Q96MU5 243 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 SEM1Q6ZVN7 128 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 PTPN13Q12923 2485 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 H7C423 109 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 COX7B2Q8TF08 81 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 A6NDX4 124 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 LGALS9O00182 355 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 IGLV1-47P01700 117 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 Q9H8V8 135 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 SPG11Q96JI7 2443 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 A0A1W2PPM0 123 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 K7EN84 100 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 NDUFB1O75438 58 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 Q8NA96 180 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 SPRNQ5BIV9 151 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 COL4A3Q01955 1670 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 TEX22C9J3V5 150 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 LINC00574Q9H8X3 128 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 LYRM9A8MSI8 78 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 IGLV2-23P01705 113 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 CTRLP40313 264 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 NDUFS5O43920 106 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 IGKV1-17P01599 117 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 Q6YL49 198 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 RITA1Q96K30 269 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 NAV3Q8IVL0 2385 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 F6UB75 175 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 HILS1P60008 231 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 HAMPP81172 84 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 MORN5Q5VZ52 161 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 TOMM6Q96B49 74 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 PRO0255Q9UI72 69 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF124Q15973 351 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 ODF3L1Q8IXM7 274 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 UBE2AP49459 152 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 Q8N1Y9 231 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 Q8N7P7 452 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 CARD19Q96LW7 228 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 IGLC2P0DOY2 106 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 IGLC3P0DOY3 106 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 C15orf53Q8NAA6 179 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 C5orf38Q86SI9 138 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF747Q9BV97 191 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 TIMM17AQ99595 171 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 K7EP34 96 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 SHISA2Q6UWI4 295 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 C12orf74Q32Q52 190 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 TRACP01848 142 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 IGF1P05019 195 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF843Q8N446 348 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 CFC1BP0CG36 223 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 CFC1P0CG37 223 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 IGLL1P15814 213 aa4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-226ENST00000546160 PDE6GP18545 87 aa4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms