RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 SLAQ13239 276 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 NAT8Q9UHE5 227 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 H3BNG1 76 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 RS1O15537 224 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 NXPH4O95158 308 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 IGLC6P0CF74 106 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 HOXA5P20719 270 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 CT83Q5H943 113 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 ZFP82Q8N141 532 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 SYT8Q8NBV8 401 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 SEC11CQ9BY50 192 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A1W2PPQ1 181 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 A8MWV9 139 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 F2Z2F3 143 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 CCL18P55774 89 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 ERVFC1-1P60608 527 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 FHL2Q14192 279 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 ISOC2Q96AB3 205 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF479Q96JC4 524 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 OSTCQ9NRP0 149 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 PRO0255Q9UI72 69 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-212ENST00000541770 HERC1Q15751 4861 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 A8MWL6 223 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV3-53P01767 116 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 GZMBP10144 247 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 KRTAP10-2P60368 255 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 ADIRFQ15847 76 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 WDR73Q6P4I2 378 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 SVBPQ8N300 66 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 SFRP2Q96HF1 295 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM231BA6NCW3 169 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 M0R381 172 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 RHODO00212 210 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 SNAPINO95295 136 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 CTRLP40313 264 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 CRYBA4P53673 196 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 CACNG7P62955 275 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 CNFNQ9BYD5 112 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 V9GYV3 84 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6□□□□□ -1.45
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CLSTN3-212ENST00000541770 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 PAX4O43316 350 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 SCO1O75880 301 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 CRYGDP07320 174 aa6□□□□□ -1.45
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CLSTN3-212ENST00000541770 OR10G8Q8NGN5 311 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 TSKUQ8WUA8 353 aa6□□□□□ -1.45
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CLSTN3-212ENST00000541770 TPPP3Q9BW30 176 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 Q9H8V8 135 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 JPT2Q9H910 190 aa6□□□□□ -1.45
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CLSTN3-212ENST00000541770 FRZBQ92765 325 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 AP1S3Q96PC3 154 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A096LPF7 62 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 PPP1R2P9O14990 202 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 TRGC1P0CF51 173 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 NTF3P20783 257 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 TTC32Q5I0X7 151 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-212ENST00000541770 RPS10P5Q9NQ39 176 aa5.98□□□□□ -1.45
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