RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 DEFB4AO15263 64 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 HLA-DMBP28068 263 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 PSMB2P49721 201 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 PCP2Q8IVA1 136 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 HIST1H4GQ99525 98 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 PRNTQ86SH4 94 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 GPHB5Q86YW7 130 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 C18orf15Q96N68 181 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 PRSS1P07477 247 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 P0C879 139 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 FXYD2P54710 66 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 Q6ZUT4 128 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 NUP35Q8NFH5 326 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 C17orf77Q96MU5 243 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 SPXQ9BT56 116 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 TMEM213A2RRL7 107 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 CCDC179H3BU77 68 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 HBBP68871 147 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 Q8N2B8 174 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 LINC00479Q96M42 142 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 LINC01587Q99440 93 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 EVI2AP22794 236 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.65□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 XGP55808 180 aa6.65□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 DEFB135Q30KP9 77 aa6.65□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.65□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 GNG5P63218 68 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 C9JCJ5 164 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 BRI3O95415 125 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 PTH2Q96A98 100 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 ZMAT4Q9H898 229 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 AGRNO00468 2067 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 ORM1P02763 201 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 Q8TAT8 98 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 P01737 135 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 MORN5Q5VZ52 161 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 KIR2DL4Q99706 377 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 FOXI1Q12951 378 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 Q9H3A6 140 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 VWFP04275 2813 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 BUB3O43684 328 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 ERCC8Q13216 396 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 RRN3P1Q2M238 152 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 NCR2O95944 276 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 IFITM1P13164 125 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 CFHR3Q02985 330 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 A4D1N5 150 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 DEFB130BP0DP73 79 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 DEFB130AP0DP74 79 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 C5orf47Q569G3 176 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 FNDC10F2Z333 226 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 IGLL5B9A064 214 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 PATE2Q6UY27 113 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 H7C2G1 150 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 LINC01545Q5VT33 79 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 THAP8Q8NA92 274 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 GTSF1Q8WW33 167 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-202ENST00000538886 TMEM262E9PQX1 116 aa6.59□□□□□ -1.36
GGA3-202ENST00000538886 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
GGA3-202ENST00000538886 Q6AWC8 147 aa6.59□□□□□ -1.36
GGA3-202ENST00000538886 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.59□□□□□ -1.36
GGA3-202ENST00000538886 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.59□□□□□ -1.36
GGA3-202ENST00000538886 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.58□□□□□ -1.36
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