RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	CNFN	Q9BYD5	112 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	PRO0255	Q9UI72	69 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	HIGD1C	A8MV81	97 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	SNAPIN	O95295	136 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	GZMB	P10144	247 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	IMMP2L	Q96T52	175 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730		A0A1B0GUT8	65 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	TWIST1	Q15672	202 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	RNF212	Q495C1	297 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	ADCYAP1	P18509	176 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	S100P	P25815	95 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF575	Q86XF7	245 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	BTF3L4	Q96K17	158 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730		A0A087WWC5	75 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	APOC3	P02656	99 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	NTF3	P20783	257 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	GTSF1	Q8WW33	167 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-224	ENST00000534730	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	IGLL5	B9A064	214 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730		H7C1H1	209 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	PAX4	O43316	350 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	IGHV3-53	P01767	116 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	RAB4B	P61018	213 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	RHOH	Q15669	191 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	FRZB	Q92765	325 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		10.76	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		10.76	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	NUP35	Q8NFH5	326 aa		10.76	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF479	Q96JC4	524 aa		10.76	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		10.75	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		10.75	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	CRYBA4	P53673	196 aa		10.75	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	FHL2	Q14192	279 aa		10.75	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		10.75	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		10.75	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	HERC2	O95714	4834 aa		10.75	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		10.74	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		10.74	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730		F5H697	171 aa		10.74	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	CRYGD	P07320	174 aa		10.74	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	SST	P61278	116 aa		10.74	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		10.74	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		10.74	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730		A0A087WWL8	130 aa		10.73	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		10.73	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		10.73	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF56	Q15929	161 aa		10.73	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	RASL11A	Q6T310	242 aa		10.73	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		10.73	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		10.73	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730		K7EQD1	137 aa		10.72	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	PPP1R17	O96001	155 aa		10.72	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	HOXA5	P20719	270 aa		10.72	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	HBB	P68871	147 aa		10.72	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	COX19	Q49B96	90 aa		10.72	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730		P0DMU3	169 aa		10.71	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	FAM231A	P0DMU4	169 aa		10.71	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	FAM231C	P0DMU5	169 aa		10.71	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	SRI	P30626	198 aa		10.71	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		10.71	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		10.71	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
BBS1-224	ENST00000534730	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		10.7	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730	NUDT3	O95989	172 aa		10.7	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730	MGP	P08493	103 aa		10.7	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730	EVI2A	P22794	236 aa		10.7	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		10.7	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		10.7	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730	JPT2	Q9H910	190 aa		10.7	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730	NACA	E9PAV3	2078 aa		10.7	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730	KMT2A	Q03164	3969 aa		10.69	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730		A0A0J9YY99	117 aa		10.69	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730	GYPE	P15421	78 aa		10.69	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730	CCL18	P55774	89 aa		10.69	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		10.69	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730	MRAP2	Q96G30	205 aa		10.69	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		10.69	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		10.69	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730	CAMP	P49913	170 aa		10.68	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		10.68	□□□□□ -0.7
BBS1-224	ENST00000534730	APLN	Q9ULZ1	77 aa		10.68	□□□□□ -0.7

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