RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532353.1

TRAF3IP2-AS1-210, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 576 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.61□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.61□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PRO0255Q9UI72 69 aa8.61□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 RYR2Q92736 4967 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 A0A087WWL8 130 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 FAM231BA6NCW3 169 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PAX4O43316 350 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SLAQ13239 276 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.59□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 HIGD1CA8MV81 97 aa8.59□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 NUDT3O95989 172 aa8.59□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 NTF3P20783 257 aa8.59□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 RNF212Q495C1 297 aa8.59□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.59□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.59□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.59□□□□□ -1.03
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LYSTQ99698 3801 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 RHODO00212 210 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LINC00315P59091 139 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 NUP35Q8NFH5 326 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 A0A096LPF7 62 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PPP1R2P9O14990 202 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 GYPEP15421 78 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TWIST1Q15672 202 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 AP1S3Q96PC3 154 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 K7EQD1 137 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 MT-ND4LP03901 98 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 EVI2AP22794 236 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 Q9UF83 564 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LCE6AA0A183 80 aa8.55□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 A0A1B0GUT8 65 aa8.55□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TRGC1P0CF51 173 aa8.55□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 RAB4BP61018 213 aa8.55□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 RHOHQ15669 191 aa8.55□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.55□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.55□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.55□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SMIM17P0DL12 118 aa8.54□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 P0DMU3 169 aa8.54□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 FAM231AP0DMU4 169 aa8.54□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 FAM231CP0DMU5 169 aa8.54□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 BORCS7Q96B45 105 aa8.54□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.54□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 F5H697 171 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LY6G6CO95867 125 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 MGPP08493 103 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LINC00694P0DN24 101 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 RIGQ13278 110 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ZNF56Q15929 161 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 ESRGQ1W209 222 aa8.53□□□□□ -1.04
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SRIP30626 198 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 GAGE12JA6NER3 117 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 M0QY20 66 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 CCL18P55774 89 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 GAGE1Q13065 139 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 GAGE4Q13068 117 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 GAGE5Q13069 117 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 GAGE13Q4V321 117 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 A0A087WWC5 75 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 A0A1B0GXF2 115 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 APOC3P02656 99 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 NDUFA5Q16718 116 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 IMMP2LQ96T52 175 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 A0A1B0GW15 77 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 UBE2D3P61077 147 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 UBE2D2P62837 147 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 RHEBQ15382 184 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 GATD1Q8NB37 220 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms