RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515143.5

SPOCK3-223, Transcript of SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3, human

TSL 4

Gene SPOCK3, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPOCK3-223	ENST00000515143	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143		Q9UF83	564 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	SNAI2	O43623	268 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	GCSH	P23434	173 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	UBE2G2	P60604	165 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143		Q6ZSA8	131 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143		Q8N814	137 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	JPT2	Q9H910	190 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	HERC1	Q15751	4861 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	PAGE4	O60829	102 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	RAB5C	P51148	216 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	RAB4B	P61018	213 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	UBE2D3	P61077	147 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	UBE2D2	P62837	147 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	TMUB2	Q71RG4	321 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	NIT1	Q86X76	327 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	BCL2L11	O43521	198 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	UBE2G1	P62253	170 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143		H3BVH4	76 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	GAGE1	Q13065	139 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	GAGE4	Q13068	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	GAGE5	Q13069	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	ELOB	Q15370	118 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143		M0R036	132 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	PSCA	O43653	123 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	AKR1C3	P42330	323 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	SULT1A2	P50226	295 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	CCL20	P78556	96 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143		A0A087WWL8	130 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.76	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	PKIA	P61925	76 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143		Q0VG73	95 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	WFDC2	Q14508	124 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143		Q8N3U1	123 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143		Q8N976	141 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	FRZB	Q92765	325 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	RMI2	Q96E14	147 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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