RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131		M0R381	172 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131		P01737	135 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	CRYGD	P07320	174 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	SRI	P30626	198 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	RHOH	Q15669	191 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	NUDT11	Q96G61	164 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	RHOD	O00212	210 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q9H8V8	135 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	GZMB	P10144	247 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	XKRY2	A2RUG3	117 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131		C9JQL5	133 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC00694	P0DN24	101 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	CEBPG	P53567	150 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	TIRAP	P58753	221 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A087WWL8	130 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF727	A8MUV8	499 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC01551	Q86U37	167 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q9UF83	564 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A1W2PPQ1	181 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131		F2Z2F3	143 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	CTRL	P40313	264 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	CACNG7	P62955	275 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	PEA15	Q15121	130 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	CNFN	Q9BYD5	112 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	SIVA1	O15304	175 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC00315	P59091	139 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	WDR73	Q6P4I2	378 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAB4B	P61018	213 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	CT83	Q5H943	113 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	TTC32	Q5I0X7	151 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	GTSF1	Q8WW33	167 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	AP1S3	Q96PC3	154 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	TPPP3	Q9BW30	176 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	ERVFC1-1	P60608	527 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	IFITM2	Q01629	132 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	OSTC	Q9NRP0	149 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	GAGE12J	A6NER3	117 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	SST	P61278	116 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	GAGE1	Q13065	139 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	GAGE4	Q13068	117 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	GAGE5	Q13069	117 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	GAGE13	Q4V321	117 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	HERC1	Q15751	4861 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131		A8MWL6	223 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	NTF3	P20783	257 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAB14	P61106	215 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	CLLU1	Q5K131	121 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	ISOC2	Q96AB3	205 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	EVI2A	P22794	236 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF56	Q15929	161 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	LELP1	Q5T871	98 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	C6orf223	Q8N319	242 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	NAT8	Q9UHE5	227 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131		K7EP13	123 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMIM17	P0DL12	118 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		11.73	□□□□□ -0.53

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