RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.47□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 DUX5Q96PT3 197 aa6.47□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.47□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 A0A0G2JNJ9 132 aa6.47□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 P0DMU3 169 aa6.47□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 FAM231AP0DMU4 169 aa6.47□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 FAM231CP0DMU5 169 aa6.47□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 GATA4P43694 442 aa6.47□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.47□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00477Q96M19 166 aa6.47□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 Q9UFV3 132 aa6.47□□□□□ -1.37
VWA3B-220ENST00000495571 C17orf100A8MU93 164 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 J3QQQ9 107 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 M0R381 172 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 UQCRQO14949 82 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 DEFB1P60022 68 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 LY6DQ14210 128 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 LINC01559Q495D7 138 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 PRR9Q5T870 116 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 GFRALQ6UXV0 394 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM223A0PJW6 202 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 OVOL1O14753 267 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 MFAP4P55083 255 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 DPH3Q96FX2 82 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.46□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 ATRXP46100 2492 aa6.45□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 K7ENP7 123 aa6.45□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 CCL8P80075 99 aa6.45□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.45□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.45□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 NACAE9PAV3 2078 aa6.45□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.45□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 F8W735 103 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 CRYGBP07316 175 aa6.45□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 RHOHQ15669 191 aa6.45□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.45□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.44□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 A8MZ25 164 aa6.44□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 MGPP08493 103 aa6.44□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.44□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.44□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 PRORYQ9H606 182 aa6.44□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1B0GX51 115 aa6.44□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 RNF7Q9UBF6 113 aa6.44□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 MUC4Q99102 2169 aa6.43□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 PLGLAQ15195 96 aa6.43□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 Q6ZT83 130 aa6.43□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.43□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 JPT2Q9H910 190 aa6.43□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.43□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 IGIPA6NJ69 53 aa6.43□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 PRSS2P07478 247 aa6.43□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 COX7CP15954 63 aa6.43□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 DLX6P56179 175 aa6.43□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM219Q86XT9 240 aa6.43□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 DAND5Q8N907 189 aa6.43□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.43□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 A0A0B4J2C4 111 aa6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 M0R1B8 84 aa6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV1-46P01743 117 aa6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 A0A087WVE0 104 aa6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 I3L3M4 83 aa6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 GPHB5Q86YW7 130 aa6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 LINC01600Q96MT4 127 aa6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.41□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.41□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV1-44P01699 117 aa6.41□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.41□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 MDS2Q8NDY4 140 aa6.41□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 PDE6HQ13956 83 aa6.41□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.41□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.41□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 LITAFQ99732 161 aa6.41□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.41□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 EDN2P20800 178 aa6.41□□□□□ -1.38
VWA3B-220ENST00000495571 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms