RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495426.1

BBS9-213, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 9, human

TSL 3

Gene BBS9, Length 481 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS9-213	ENST00000495426	BTC	P35070	178 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426		Q6ZRU5	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	NIT1	Q86X76	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426		A0A087WWC5	75 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	S100A5	P33763	92 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426		Q75L30	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	PARL	Q9H300	379 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	NMES1	Q9C002	83 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	OTOR	Q9NRC9	128 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426		Q9UF83	564 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426		A0A087WX48	190 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426		A0A0D9SG52	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	PGP	A6NDG6	321 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	CENPX	A8MT69	81 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	PANO1	I0J062	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	CRP	P02741	224 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	GNG5	P63218	68 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426		Q0VG73	95 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	ELOB	Q15370	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	PTH2	Q96A98	100 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BBS9-213	ENST00000495426		A8MWV9	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	GCG	P01275	180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	TAS2R45	P59539	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	JPT2	Q9H910	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	LPA	P08519	4548 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	TAAR5	O14804	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	PRSS1	P07477	247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	IL15RA	Q13261	267 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	MBD2	Q9UBB5	411 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	IL7	P13232	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426		H3BVH4	76 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	LYRM1	O43325	122 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS9-213	ENST00000495426	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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