RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 A8MWV9 139 aa8.25□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 D6R8Y8 96 aa8.25□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 CRYGDP07320 174 aa8.25□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 DEFB135Q30KP9 77 aa8.25□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.25□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 RNF183Q96D59 192 aa8.25□□□□□ -1.09
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C9orf3-220ENST00000489318 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.25□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 S100A6P06703 90 aa8.24□□□□□ -1.09
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C9orf3-220ENST00000489318 JPT2Q9H910 190 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
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C9orf3-220ENST00000489318 SMIM17P0DL12 118 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf3-220ENST00000489318 MIFP14174 115 aa8.23□□□□□ -1.09
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C9orf3-220ENST00000489318 NRACQ8N912 160 aa8.23□□□□□ -1.09
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C9orf3-220ENST00000489318 C18orf15Q96N68 181 aa8.23□□□□□ -1.09
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C9orf3-220ENST00000489318 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf3-220ENST00000489318 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.2□□□□□ -1.1
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C9orf3-220ENST00000489318 H7C1H1 209 aa8.18□□□□□ -1.1
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C9orf3-220ENST00000489318 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.18□□□□□ -1.1
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C9orf3-220ENST00000489318 DNHD1Q96M86 4753 aa8.17□□□□□ -1.1
C9orf3-220ENST00000489318 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
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C9orf3-220ENST00000489318 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.17□□□□□ -1.1
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C9orf3-220ENST00000489318 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.16□□□□□ -1.1
C9orf3-220ENST00000489318 GAGE12BA1L429 117 aa8.16□□□□□ -1.1
C9orf3-220ENST00000489318 F5H697 171 aa8.16□□□□□ -1.1
C9orf3-220ENST00000489318 GAGE7O76087 117 aa8.16□□□□□ -1.1
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C9orf3-220ENST00000489318 LINC00614P0C842 121 aa8.16□□□□□ -1.1
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C9orf3-220ENST00000489318 GAGE12GP0CL81 117 aa8.16□□□□□ -1.1
C9orf3-220ENST00000489318 GAGE12IP0CL82 117 aa8.16□□□□□ -1.1
C9orf3-220ENST00000489318 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
C9orf3-220ENST00000489318 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.16□□□□□ -1.1
C9orf3-220ENST00000489318 NIT1Q86X76 327 aa8.16□□□□□ -1.1
C9orf3-220ENST00000489318 Q8N8P6 123 aa8.16□□□□□ -1.1
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF479Q96JC4 524 aa8.16□□□□□ -1.1
C9orf3-220ENST00000489318 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
C9orf3-220ENST00000489318 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.15□□□□□ -1.1
C9orf3-220ENST00000489318 K7EMI3 77 aa8.15□□□□□ -1.1
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