RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 XKRY2A2RUG3 117 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 SNAI2O43623 268 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 P01737 135 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 CRYGDP07320 174 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 OR5AL1P0C617 328 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 EVI2AP22794 236 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 SSTP61278 116 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 WFDC10BQ8IUB3 73 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 OR10AG1Q8NH19 301 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 FRAS1Q86XX4 4008 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 MUC21A0A140T8X8 626 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1B0GVY2 172 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 C19orf71A6NCJ1 209 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 OR10J3Q5JRS4 329 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa13.15□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM250H0YL14 139 aa13.15□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 TNP2Q05952 138 aa13.15□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 TPPP3Q9BW30 176 aa13.15□□□□□ -0.3
SH3BP4-209ENST00000484097 K7EP13 123 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 GZMBP10144 247 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 CEBPGP53567 150 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 TOR2AQ5JU69 321 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 LELP1Q5T871 98 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAH10OSP0CZ25 163 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 SMIM17P0DL12 118 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 LINC00315P59091 139 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 OCC1Q8TAD7 63 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 RAB4BP61018 213 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF56Q15929 161 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 C10orf126Q8N4M7 172 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 NUDT10Q8NFP7 164 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 NUDT11Q96G61 164 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 F5H697 171 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 CACNG7P62955 275 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 NFE4Q86UQ8 179 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM210AQ96ND0 272 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 Q9UF83 564 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 F2Z2F3 143 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 IGLC6P0CF74 106 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 AP1S3Q96PC3 154 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A087WWC5 75 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 LINC00694P0DN24 101 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 TEX261Q6UWH6 196 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 MSRB1Q9NZV6 116 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAH17Q9UFH2 4485 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAH2Q9P225 4427 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-209ENST00000484097 K7EN84 100 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 LINC01556Q5JQF7 62 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 LYZL1Q6UWQ5 148 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 SMIM7Q9BQ49 75 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF727A8MUV8 499 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 GATCO43716 136 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHV3-30P01768 117 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHV3-33P01772 117 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 MGPP08493 103 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 SRP19P09132 144 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 TRGC1P0CF51 173 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 NTF3P20783 257 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 ERVFC1-1P60608 527 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 UBE2D3P61077 147 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 UBE2D2P62837 147 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 WDR73Q6P4I2 378 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 OR10G8Q8NGN5 311 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 EREGO14944 169 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM231DQ6ZW35 169 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-209ENST00000484097 A8MWL6 223 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 PEA15Q15121 130 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 TWIST1Q15672 202 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 FAT2Q9NYQ8 4349 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 H7C1H1 209 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 CTRLP40313 264 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 SPATA12Q7Z6I5 190 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 DPH3P1Q9H4G8 78 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 C16orf90A8MZG2 172 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 PSCAO43653 123 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM74A3Q4VXF1 159 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 KCNIP4Q6PIL6 250 aa13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms