RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	SRI	P30626	198 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	ESRG	Q1W209	222 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	CT83	Q5H943	113 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887		Q6ZSN1	163 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	UPK3B	Q9BT76	320 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	CNFN	Q9BYD5	112 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887		A0A087WWL8	130 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887		F2Z2F3	143 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	LINC00694	P0DN24	101 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	ERVFC1-1	P60608	527 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	CACNG7	P62955	275 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	ISOC2	Q96AB3	205 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	AP1S3	Q96PC3	154 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	OSTC	Q9NRP0	149 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	NAT8	Q9UHE5	227 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	NACA	E9PAV3	2078 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887		A8MWL6	223 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	TIRAP	P58753	221 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	WDR73	Q6P4I2	378 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887		Q6ZR54	194 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	GTSF1	Q8WW33	167 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	TPPP3	Q9BW30	176 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SFI1-222	ENST00000478887	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	FAM231B	A6NCW3	169 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	TRGC1	P0CF51	173 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	NTF3	P20783	257 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	LINC00315	P59091	139 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	RAB4B	P61018	213 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	ADIRF	Q15847	76 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF56	Q15929	161 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	TSKU	Q8WUA8	353 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887		Q9UF83	564 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887		V9GYV3	84 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	GAGE12J	A6NER3	117 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	SMIM17	P0DL12	118 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	SST	P61278	116 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	GAGE1	Q13065	139 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	GAGE4	Q13068	117 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	GAGE5	Q13069	117 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	GAGE13	Q4V321	117 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	UQCC3	Q6UW78	93 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887		Q9H8V8	135 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	KMT2A	Q03164	3969 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	HIGD1C	A8MV81	97 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887		M0R2N4	97 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	SIVA1	O15304	175 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	EVI2A	P22794	236 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	TTC32	Q5I0X7	151 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	MGP	P08493	103 aa		6.48	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	UBE2D3	P61077	147 aa		6.48	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	UBE2D2	P62837	147 aa		6.48	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	6.48	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	TWIST1	Q15672	202 aa		6.48	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	LELP1	Q5T871	98 aa		6.48	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		6.48	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		6.48	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		6.48	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		6.47	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887		A0A1B0GUT8	65 aa		6.47	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		6.47	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887		F5H697	171 aa		6.47	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887		M0QY20	66 aa		6.47	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		6.47	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		6.47	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	BORCS7	Q96B45	105 aa		6.47	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		6.47	□□□□□ -1.37
SFI1-222	ENST00000478887		A0A087WWC5	75 aa		6.46	□□□□□ -1.38

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