RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471643.1

RALGPS1-211, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 681 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-211ENST00000471643 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.95□□□□□ -0.98
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RALGPS1-211ENST00000471643 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.95□□□□□ -0.98
RALGPS1-211ENST00000471643 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RALGPS1-211ENST00000471643 IL36BQ9NZH7 164 aa8.95□□□□□ -0.98
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RALGPS1-211ENST00000471643 RBX1P62877 108 aa8.94□□□□□ -0.98
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RALGPS1-211ENST00000471643 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.91□□□□□ -0.98
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RALGPS1-211ENST00000471643 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.91□□□□□ -0.98
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RALGPS1-211ENST00000471643 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.91□□□□□ -0.98
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RALGPS1-211ENST00000471643 DNLZQ5SXM8 178 aa8.9□□□□□ -0.98
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RALGPS1-211ENST00000471643 C15orf56Q8N910 161 aa8.89□□□□□ -0.99
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RALGPS1-211ENST00000471643 TRAV6A0A075B6T7 132 aa8.85□□□□□ -0.99
RALGPS1-211ENST00000471643 K7EQM0 130 aa8.85□□□□□ -0.99
RALGPS1-211ENST00000471643 M0R036 132 aa8.85□□□□□ -0.99
RALGPS1-211ENST00000471643 SUN5Q8TC36 379 aa8.85□□□□□ -0.99
RALGPS1-211ENST00000471643 EPDR1Q9UM22 224 aa8.85□□□□□ -0.99
RALGPS1-211ENST00000471643 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.85□□□□□ -0.99
RALGPS1-211ENST00000471643 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.84□□□□□ -0.99
RALGPS1-211ENST00000471643 CENPXA8MT69 81 aa8.84□□□□□ -0.99
RALGPS1-211ENST00000471643 PLA2G10O15496 165 aa8.84□□□□□ -0.99
RALGPS1-211ENST00000471643 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.84□□□□□ -0.99
RALGPS1-211ENST00000471643 RAB4BP61018 213 aa8.84□□□□□ -0.99
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RALGPS1-211ENST00000471643 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
RALGPS1-211ENST00000471643 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.84□□□□□ -0.99
RALGPS1-211ENST00000471643 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.83□□□□□ -1
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RALGPS1-211ENST00000471643 GZMBP10144 247 aa8.83□□□□□ -1
RALGPS1-211ENST00000471643 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.83□□□□□ -1
RALGPS1-211ENST00000471643 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.83□□□□□ -1
RALGPS1-211ENST00000471643 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RALGPS1-211ENST00000471643 DERL1Q9BUN8 251 aa8.83□□□□□ -1
RALGPS1-211ENST00000471643 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
RALGPS1-211ENST00000471643 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.83□□□□□ -1
RALGPS1-211ENST00000471643 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.82□□□□□ -1
RALGPS1-211ENST00000471643 A0A1W2PPV4 95 aa8.82□□□□□ -1
RALGPS1-211ENST00000471643 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
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