RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467538.5

ST7-223, Transcript of suppression of tumorigenicity 7, human

TSL 5

Gene ST7, Length 565 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ST7-223	ENST00000467538	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	CITED1	Q99966	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538		A0A0J9YX75	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	KLLN	B2CW77	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	CTRL	P40313	264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	LEP	P41159	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	RAB5B	P61020	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	OR5I1	Q13606	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	SH2D1A	O60880	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538		A0A1B0GUT8	65 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538		A0A1B0GXF2	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	CRIP1	P50238	77 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	HBB	P68871	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	CXCL6	P80162	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	FRZB	Q92765	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538		H3BMM0	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	PHOX2A	O14813	284 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	CDKN1B	P46527	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538		Q8TAT8	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	MAST4	O15021	2626 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	ATR	Q13535	2644 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	C7orf71	A4D174	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	SNAI2	O43623	268 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	GPX1	P07203	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	CACNG7	P62955	275 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	ERCC8	Q13216	396 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	ORM1	P02763	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	PPBP	P02775	128 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	TRGC2	P03986	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	S100A6	P06703	90 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	DEFB131A	P59861	70 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ST7-223	ENST00000467538	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms