RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465894.6

SH3BP5-209, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-209ENST00000465894 C3orf79P0CE67 100 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 NTF3P20783 257 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 ZNF415Q09FC8 603 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 ORMDL3Q8N138 153 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 C9orf85Q96MD7 179 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 PRO1933Q9H354 126 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 SCRT2Q9NQ03 307 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 MDFICQ9P1T7 246 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 SSTP61278 116 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 TWIST1Q15672 202 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 PET117Q6UWS5 81 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP5-209ENST00000465894 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 LEPROTL1O95214 131 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 PRM2P04554 102 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 AZU1P20160 251 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 RRN3P1Q2M238 152 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 Q8N976 141 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 OR10AG1Q8NH19 301 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 SPXQ9BT56 116 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 FA2HQ7L5A8 372 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 SYT8Q8NBV8 401 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 C16orf74Q96GX8 76 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 M0R143 59 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 M0R381 172 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 SPRY2O43597 315 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 DEFB135Q30KP9 77 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 RNF183Q96D59 192 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 PRELID3AQ96N28 172 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 MUC4Q99102 2169 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 LINC01546A6NGU7 62 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 M0R2P5 195 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 DEFB121Q5J5C9 76 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 PTH2Q96A98 100 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 K7EIL1 84 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 NXPH4O95158 308 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 ZNF876PQ49A33 203 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 OR11H2Q8NH07 326 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 ST20Q9HBF5 79 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 X6R8D5 127 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 D6R8Y8 96 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 CKS2P33552 79 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 SPATA45Q537H7 98 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 PRSS47A8MTI9 375 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 MIFP14174 115 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 IL17DQ8TAD2 202 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 AP1S3Q96PC3 154 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP5-209ENST00000465894 ANK2Q01484 3957 aa9.65□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 K7EMI3 77 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 PPP1R17O96001 155 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 SMIM17P0DL12 118 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 IGLC3P0DOY3 106 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 EVI2AP22794 236 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 AMN1Q8IY45 258 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 RASL10AQ92737 203 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 MRAP2Q96G30 205 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 CMYA5Q8N3K9 4069 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 HBDP02042 147 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 LINC01545Q5VT33 79 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP5-209ENST00000465894 A8MWV9 139 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms