RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464710.1

IL6-208, Transcript of interleukin 6, human

TSL 4

Gene IL6, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL6-208	ENST00000464710	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		5.87	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710		A0A1B0GUT8	65 aa		5.86	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	FAM231B	A6NCW3	169 aa		5.86	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	RHOD	O00212	210 aa		5.86	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	CRYGD	P07320	174 aa		5.86	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	TCTA	P57738	103 aa		5.86	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	ZNF56	Q15929	161 aa		5.86	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		5.86	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		5.86	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		5.86	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	NUP35	Q8NFH5	326 aa		5.86	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	AP1S3	Q96PC3	154 aa		5.86	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		5.86	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	APLN	Q9ULZ1	77 aa		5.86	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710		A0A096LPF7	62 aa		5.85	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		5.85	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		5.85	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	GYPE	P15421	78 aa		5.85	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	EVI2A	P22794	236 aa		5.85	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	CTRL	P40313	264 aa		5.85	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	CAMP	P49913	170 aa		5.85	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		5.85	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710		Q6ZSN1	163 aa		5.85	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		5.85	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		5.85	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		5.85	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		5.85	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		5.85	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	MUC4	Q99102	2169 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	GAGE12J	A6NER3	117 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	NXPH4	O95158	308 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	LY6G6C	O95867	125 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	S100P	P25815	95 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	RAB4B	P61018	213 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	GAGE1	Q13065	139 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	GAGE4	Q13068	117 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	GAGE5	Q13069	117 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	RHOH	Q15669	191 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	GAGE13	Q4V321	117 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710	SVBP	Q8N300	66 aa		5.84	□□□□□ -1.47
IL6-208	ENST00000464710		H3BNG1	76 aa		5.83	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710		K7EQD1	137 aa		5.83	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	SNAPIN	O95295	136 aa		5.83	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	SRI	P30626	198 aa		5.83	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	CCL18	P55774	89 aa		5.83	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		5.83	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		5.83	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		5.83	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	TENM3	Q9P273	2699 aa		5.83	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	NACA	E9PAV3	2078 aa		5.83	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	S100A8	P05109	93 aa		5.82	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710		P0DMU3	169 aa		5.82	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	FAM231A	P0DMU4	169 aa		5.82	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	FAM231C	P0DMU5	169 aa		5.82	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	RHEB	Q15382	184 aa		5.82	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		5.82	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		5.82	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	CNFN	Q9BYD5	112 aa		5.82	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		5.82	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		5.82	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710		A0A1B0GW15	77 aa		5.81	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710		H7C1H1	209 aa		5.81	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	LINC00315	P59091	139 aa		5.81	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	HBB	P68871	147 aa		5.81	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	ESRG	Q1W209	222 aa		5.81	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		5.81	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		5.81	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	BTF3L4	Q96K17	158 aa		5.81	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	IMMP2L	Q96T52	175 aa		5.81	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		5.81	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710		Q9UF83	564 aa		5.81	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710		A0A087WWC5	75 aa		5.8	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		5.8	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		5.8	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	RAB4A	P20338	218 aa		5.8	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		5.8	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	RASL11A	Q6T310	242 aa		5.8	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		5.8	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	AMN1	Q8IY45	258 aa		5.8	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		5.8	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	TG	P01266	2768 aa		5.8	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	COL7A1	Q02388	2944 aa		5.8	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		5.79	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		5.79	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710		M0QY20	66 aa		5.79	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		5.79	□□□□□ -1.48
IL6-208	ENST00000464710	GATD1	Q8NB37	220 aa		5.79	□□□□□ -1.48

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