RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463369.5

SHQ1-203, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SHQ1, Length 2,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-203ENST00000463369 IGHV4-39P01824 125 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 KRTAP10-9P60411 292 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 FBXL15Q9H469 300 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.65□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 H7C1H1 209 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 TCL1BO95988 128 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 APELAP0DMC3 54 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 ASIPP42127 132 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 LAGE3Q14657 143 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 SFTA2Q6UW10 78 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 F8VRH5 84 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 IGKV1-17P01599 117 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 PDE6HQ13956 83 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 ABCA1O95477 2261 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 CR1P17927 2039 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 I3L2K1 104 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 CD7P09564 240 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 IFITM1P13164 125 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 TTC32Q5I0X7 151 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 Q6Q795 121 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 H3BVH4 76 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 SNCGO76070 127 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 LINC00311Q8N616 119 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 Q96MF0 132 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 CTSZQ9UBR2 303 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 NDUFB3O43676 98 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 CCL3L1P16619 93 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 CRLF1O75462 422 aa6.61□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.61□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 Q75L30 129 aa6.61□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.61□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 NRACQ8N912 160 aa6.61□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.61□□□□□ -1.35
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SHQ1-203ENST00000463369 ZNF815PA8K554 130 aa6.61□□□□□ -1.35
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SHQ1-203ENST00000463369 DSCR9P59020 149 aa6.61□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 HILS1P60008 231 aa6.61□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 C4orf26Q17RF5 130 aa6.61□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.61□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.61□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.61□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.61□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 PDZD2O15018 2839 aa6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 MED13LQ71F56 2210 aa6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 C20orf173Q96LM9 149 aa6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.6□□□□□ -1.35
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SHQ1-203ENST00000463369 ITPR2Q14571 2701 aa6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 SLC25A20O43772 301 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 CNTFRP26992 372 aa6.59□□□□□ -1.35
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SHQ1-203ENST00000463369 Q8TAT8 98 aa6.59□□□□□ -1.35
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SHQ1-203ENST00000463369 K7EIM0 57 aa6.59□□□□□ -1.35
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SHQ1-203ENST00000463369 CFC1P0CG37 223 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 SLC25A16P16260 332 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 LMO4P61968 165 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-203ENST00000463369 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
SHQ1-203ENST00000463369 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-203ENST00000463369 TRGV3P03979 118 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-203ENST00000463369 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.362e-8■■■■■ 31.6
SHQ1-203ENST00000463369 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-203ENST00000463369 A0A0J9YY99 117 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-203ENST00000463369 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-203ENST00000463369 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-203ENST00000463369 RASL10AQ92737 203 aa6.57□□□□□ -1.36
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