RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449159.5

SMPD4-211, Transcript of sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMPD4, Length 635 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4-211ENST00000449159 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.39□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.39□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.39□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 OSTCQ9NRP0 149 aa7.39□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.39□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 V9GYV3 84 aa7.39□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.39□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 A0A096LPF7 62 aa7.38□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 LINC00862A6NCI5 91 aa7.38□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 H3BNG1 76 aa7.38□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 ADCYAP1P18509 176 aa7.38□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 CT83Q5H943 113 aa7.38□□□□□ -1.23
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SMPD4-211ENST00000449159 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.38□□□□□ -1.23
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SMPD4-211ENST00000449159 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.37□□□□□ -1.23
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SMPD4-211ENST00000449159 Q9UF83 564 aa7.37□□□□□ -1.23
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SMPD4-211ENST00000449159 P0DMU3 169 aa7.36□□□□□ -1.23
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SMPD4-211ENST00000449159 FAM231CP0DMU5 169 aa7.36□□□□□ -1.23
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SMPD4-211ENST00000449159 AP1S3Q96PC3 154 aa7.36□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 CNFNQ9BYD5 112 aa7.36□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.36□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.35□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 HIGD1CA8MV81 97 aa7.35□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 CIDEAO60543 219 aa7.35□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 NTF3P20783 257 aa7.35□□□□□ -1.23
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SMPD4-211ENST00000449159 F8W036 122 aa7.34□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 EVI2AP22794 236 aa7.34□□□□□ -1.23
SMPD4-211ENST00000449159 SRIP30626 198 aa7.34□□□□□ -1.23
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SMPD4-211ENST00000449159 TWIST1Q15672 202 aa7.34□□□□□ -1.23
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SMPD4-211ENST00000449159 TRGC1P0CF51 173 aa7.32□□□□□ -1.24
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SMPD4-211ENST00000449159 GAGE1Q13065 139 aa7.32□□□□□ -1.24
SMPD4-211ENST00000449159 GAGE4Q13068 117 aa7.32□□□□□ -1.24
SMPD4-211ENST00000449159 GAGE5Q13069 117 aa7.32□□□□□ -1.24
SMPD4-211ENST00000449159 GAGE13Q4V321 117 aa7.32□□□□□ -1.24
SMPD4-211ENST00000449159 SEC11CQ9BY50 192 aa7.32□□□□□ -1.24
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SMPD4-211ENST00000449159 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.31□□□□□ -1.24
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SMPD4-211ENST00000449159 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.31□□□□□ -1.24
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SMPD4-211ENST00000449159 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.31□□□□□ -1.24
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SMPD4-211ENST00000449159 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.31□□□□□ -1.24
SMPD4-211ENST00000449159 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMPD4-211ENST00000449159 MT-ND4LP03901 98 aa7.3□□□□□ -1.24
SMPD4-211ENST00000449159 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.3□□□□□ -1.24
SMPD4-211ENST00000449159 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.3□□□□□ -1.24
SMPD4-211ENST00000449159 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.29□□□□□ -1.24
SMPD4-211ENST00000449159 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.29□□□□□ -1.24
SMPD4-211ENST00000449159 M0QY20 66 aa7.29□□□□□ -1.24
SMPD4-211ENST00000449159 PPP1R2P9O14990 202 aa7.29□□□□□ -1.24
SMPD4-211ENST00000449159 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMPD4-211ENST00000449159 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.29□□□□□ -1.24
SMPD4-211ENST00000449159 UPK3BQ9BT76 320 aa7.29□□□□□ -1.24
SMPD4-211ENST00000449159 M0R2N4 97 aa7.28□□□□□ -1.24
SMPD4-211ENST00000449159 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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