RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427412.5

CITED1-204, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-204ENST00000427412 SCRT2Q9NQ03 307 aa10.29□□□□□ -0.76
CITED1-204ENST00000427412 PRO0255Q9UI72 69 aa10.29□□□□□ -0.76
CITED1-204ENST00000427412 HHLA3Q9XRX5 114 aa10.29□□□□□ -0.76
CITED1-204ENST00000427412 BTF3P20290 206 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CITED1-204ENST00000427412 CRYBA4P53673 196 aa10.28□□□□□ -0.76
CITED1-204ENST00000427412 RPS20P60866 119 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CITED1-204ENST00000427412 IFITM2Q01629 132 aa10.28□□□□□ -0.76
CITED1-204ENST00000427412 TTC32Q5I0X7 151 aa10.28□□□□□ -0.76
CITED1-204ENST00000427412 SPANXN1Q5VSR9 72 aa10.28□□□□□ -0.76
CITED1-204ENST00000427412 NUDT10Q8NFP7 164 aa10.28□□□□□ -0.76
CITED1-204ENST00000427412 NUDT11Q96G61 164 aa10.28□□□□□ -0.76
CITED1-204ENST00000427412 ICOSQ9Y6W8 199 aa10.28□□□□□ -0.76
CITED1-204ENST00000427412 A0A087WWL8 130 aa10.27□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa10.27□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 CXCL1P09341 107 aa10.27□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa10.27□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 UPK3BQ9BT76 320 aa10.27□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 SAMD10Q9BYL1 202 aa10.27□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 FAT1Q14517 4588 aa10.26□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 XKRY2A2RUG3 117 aa10.26□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 A8MWV9 139 aa10.26□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 GYPEP15421 78 aa10.26□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 SLAQ13239 276 aa10.26□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 PTH2Q96A98 100 aa10.26□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 Q9H8V8 135 aa10.26□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 A0A1W2PPQ1 181 aa10.25□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 SNAI2O43623 268 aa10.25□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 GATCO43716 136 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 KRTAP10-2P60368 255 aa10.25□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 ERVFC1-1P60608 527 aa10.25□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 ADIRFQ15847 76 aa10.25□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 CLLU1Q5K131 121 aa10.25□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 LINC01551Q86U37 167 aa10.25□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 SRIP30626 198 aa10.24□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 H3BNG1 76 aa10.23□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 K7EQD1 137 aa10.23□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 OR5AL1P0C617 328 aa10.23□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 IGLC6P0CF74 106 aa10.23□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 RHOHQ15669 191 aa10.23□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 ZNF56Q15929 161 aa10.23□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 SLC25A29Q8N8R3 303 aa10.23□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 SFRP2Q96HF1 295 aa10.23□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 PRADC1Q9BSG0 188 aa10.23□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 LY96Q9Y6Y9 160 aa10.23□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 RHODO00212 210 aa10.22□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 RPL23P62829 140 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 TMEM241Q24JQ0 296 aa10.22□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 FAM74A3Q4VXF1 159 aa10.22□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa10.22□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 LYZL1Q6UWQ5 148 aa10.22□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 Q6ZSN1 163 aa10.22□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 NAT8Q9UHE5 227 aa10.22□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 MYCBP2O75592 4640 aa10.22□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 CIDEAO60543 219 aa10.21□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 NXPH4O95158 308 aa10.21□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 MGPP08493 103 aa10.21□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 ESRGQ1W209 222 aa10.21□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 FAM231DQ6ZW35 169 aa10.21□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 AP1S3Q96PC3 154 aa10.21□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 SMDT1Q9H4I9 107 aa10.21□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
CITED1-204ENST00000427412 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa10.21□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 GAGE12JA6NER3 117 aa10.2□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 SMIM17P0DL12 118 aa10.2□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 CACNG7P62955 275 aa10.2□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 GAGE1Q13065 139 aa10.2□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 GAGE4Q13068 117 aa10.2□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 GAGE5Q13069 117 aa10.2□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 GAGE13Q4V321 117 aa10.2□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 ZFP2Q6ZN57 461 aa10.2□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 NEGR1Q7Z3B1 354 aa10.2□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 C15orf54Q8N8G6 183 aa10.2□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 ISOC2Q96AB3 205 aa10.2□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 MSRB1Q9NZV6 116 aa10.2□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa10.19□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 F5H697 171 aa10.19□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 CRYGDP07320 174 aa10.19□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 UFSP1Q6NVU6 142 aa10.19□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 PGLYRP4Q96LB8 373 aa10.19□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 A8MWL6 223 aa10.18□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 EPM2AB3EWF7 344 aa10.18□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 CTRLP40313 264 aa10.18□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 GTSF1Q8WW33 167 aa10.18□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 OSTCQ9NRP0 149 aa10.18□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 F2Z2F3 143 aa10.17□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 LINC00315P59091 139 aa10.17□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 TWIST1Q15672 202 aa10.17□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 COMMD7Q86VX2 200 aa10.17□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 OR10G8Q8NGN5 311 aa10.17□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 TRGC1P0CF51 173 aa10.16□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 NTF3P20783 257 aa10.16□□□□□ -0.78
CITED1-204ENST00000427412 CT83Q5H943 113 aa10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms