RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384668.1

RNU6-1011P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1011, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1011P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1011P-201ENST00000384668 DEFB112Q30KQ8 113 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1011P-201ENST00000384668 WFDC6Q9BQY6 131 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1011P-201ENST00000384668 WNK3Q9BYP7 1800 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1011P-201ENST00000384668 FABP2P12104 132 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1011P-201ENST00000384668 LIN52Q52LA3 116 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1011P-201ENST00000384668 NDUFA11Q86Y39 141 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1011P-201ENST00000384668 MORN4Q8NDC4 146 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1011P-201ENST00000384668 NUP35Q8NFH5 326 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1011P-201ENST00000384668 OR51A4Q8NGJ6 313 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1011P-201ENST00000384668 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1011P-201ENST00000384668 ZFYVE9O95405 1425 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1011P-201ENST00000384668 FAM135BQ49AJ0 1406 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1011P-201ENST00000384668 PAPPAQ13219 1627 aa-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 LSM6P62312 80 aaKnown RBP-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 GNG5P63218 68 aa-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 OTOSQ8NHW6 89 aa-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 PRNDQ9UKY0 176 aa-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-4.86□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 ERCC6L2Q5T890 1561 aa-4.87□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-4.87□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-4.87□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 H7C1C5 153 aa-4.87□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 ERVS71-1P61550 626 aa-4.87□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 LCN6P62502 163 aa-4.87□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 PTPRMP28827 1452 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 ADGBQ8N7X0 1667 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 CKS2P33552 79 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 AKR1D1P51857 326 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 LXNQ9BS40 222 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 G3V2T6 193 aa-4.89□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 C3orf33Q6P1S2 294 aa-4.89□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 BORCS8Q96FH0 119 aa-4.89□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa-4.89□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa-4.9□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 SLC25A6P12236 298 aa-4.9□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 S100A3P33764 101 aa-4.9□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 EDDM3BP56851 147 aa-4.9□□□□□ -3.19
RNU6-1011P-201ENST00000384668 IFT172Q9UG01 1749 aa-4.91□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 CETN3O15182 167 aa-4.91□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 DEFB105AQ8NG35 78 aa-4.91□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 BRK1Q8WUW1 75 aa-4.91□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 NDUFAF1Q9Y375 327 aa-4.91□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 RPS17P08708 135 aaKnown RBP-4.92□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 RPP14O95059 124 aaKnown RBP-4.93□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 ARF6P62330 175 aa-4.93□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 CFAP126Q5VTH2 177 aa-4.93□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 NPVFQ9HCQ7 196 aa-4.93□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 MED11Q9P086 117 aa-4.93□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 NRXN2Q9P2S2 1712 aa-4.93□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa-4.93□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 NBASA2RRP1 2371 aa-4.94□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 KIF13AQ9H1H9 1805 aa-4.94□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa-4.94□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 CSN2P05814 226 aa-4.94□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 SLC25A26Q70HW3 274 aa-4.94□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 C9orf16Q9BUW7 83 aa-4.94□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-4.94□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 SSR3Q9UNL2 185 aa-4.94□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 SH3BGRL3Q9H299 93 aa-4.95□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 MYH1P12882 1939 aa-4.95□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 TRAV2A0A0B4J234 112 aa-4.96□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 J3KT08 172 aa-4.96□□□□□ -3.2
RNU6-1011P-201ENST00000384668 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP-4.97□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 TEX29Q8N6K0 151 aa-4.97□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP-4.97□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 CCDC171Q6TFL3 1326 aa-4.97□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-4.98□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 CST2P09228 141 aa-4.98□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 SDC2P34741 201 aa-4.98□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 LTC4SQ16873 150 aa-4.98□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 TAS2R8Q9NYW2 309 aa-4.98□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP-4.99□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 GABARAPH6UMI1 98 aa-4.99□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 HBDP02042 147 aa-4.99□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 PPP1R2P41236 205 aa-4.99□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 SPCS2Q15005 226 aa-4.99□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa-4.99□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 LINC00305Q7Z4B0 112 aa-4.99□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 CROCCP2Q86T23 111 aa-4.99□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 DEFB123Q8N688 67 aa-4.99□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 ERG28Q9UKR5 140 aa-4.99□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa-4.99□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa-5□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 SMIM23A6NLE4 172 aa-5□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 LYSTQ99698 3801 aa-5.01□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa-5.01□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa-5.01□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 CRYGSP22914 178 aa-5.01□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP-5.01□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 ARMC1Q9NVT9 282 aa-5.01□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP-5.01□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 TECPR2O15040 1411 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 LSM3P62310 102 aaKnown RBP-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 DNAH11Q96DT5 4516 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1011P-201ENST00000384668 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa-5.03□□□□□ -3.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.2 ms