RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335927.11

RASGEF1B-202, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RASGEF1B, Length 1,756 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-202ENST00000335927 F2Z2F3 143 aa10□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 F8W036 122 aa10□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 CRYGDP07320 174 aa10□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 NTF3P20783 257 aa10□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 CTRLP40313 264 aa10□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 CT83Q5H943 113 aa10□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa10□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 ICOSQ9Y6W8 199 aa10□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 H3BNG1 76 aa9.99□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 CACNG7P62955 275 aa9.99□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 ZNF56Q15929 161 aa9.99□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.99□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 ZFP2Q6ZN57 461 aa9.99□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 TSKUQ8WUA8 353 aa9.99□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 HIGD1CA8MV81 97 aa9.98□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 K7EQD1 137 aa9.98□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 RHODO00212 210 aa9.98□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 P0DMU3 169 aa9.98□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 FAM231AP0DMU4 169 aa9.98□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 FAM231CP0DMU5 169 aa9.98□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 TWIST1Q15672 202 aa9.98□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 AP1S3Q96PC3 154 aa9.98□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 CIDEAO60543 219 aa9.98□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 MGPP08493 103 aa9.98□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 SMIM17P0DL12 118 aa9.98□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 Q9UF83 564 aa9.98□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.97□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 F5H697 171 aa9.97□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 EVI2AP22794 236 aa9.97□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 SRIP30626 198 aa9.97□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 RHOHQ15669 191 aa9.97□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 PRADC1Q9BSG0 188 aa9.97□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.97□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.96□□□□□ -0.81
RASGEF1B-202ENST00000335927 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.96□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 ESRGQ1W209 222 aa9.96□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 RNF212Q495C1 297 aa9.96□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 BORCS7Q96B45 105 aa9.96□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.96□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.96□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 GAGE12JA6NER3 117 aa9.95□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 TRGC1P0CF51 173 aa9.95□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 CCL18P55774 89 aa9.95□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 GAGE1Q13065 139 aa9.95□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 GAGE4Q13068 117 aa9.95□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 GAGE5Q13069 117 aa9.95□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 GAGE13Q4V321 117 aa9.95□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 NUP35Q8NFH5 326 aa9.95□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 CNFNQ9BYD5 112 aa9.95□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.94□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 SEC11CQ9BY50 192 aa9.94□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.94□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.93□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 LINC00315P59091 139 aa9.93□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 RAB4BP61018 213 aa9.93□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 WDR73Q6P4I2 378 aa9.93□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 A0A1B0GUT8 65 aa9.93□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 FAM231BA6NCW3 169 aa9.93□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.93□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.92□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 RYR2Q92736 4967 aa9.92□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.92□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 PPP1R2P9O14990 202 aa9.92□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 MT-ND4LP03901 98 aa9.92□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.92□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 RYR3Q15413 4870 aa9.92□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.91□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.91□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.91□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.91□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 ANAPC16Q96DE5 110 aa9.91□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 M0R2N4 97 aa9.9□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa9.9□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.9□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.9□□□□□ -0.82
RASGEF1B-202ENST00000335927 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9.9□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 LINC00694P0DN24 101 aa9.89□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 CAMPP49913 170 aa9.89□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 RIGQ13278 110 aa9.89□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.89□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.88□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.88□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.88□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 M0QY20 66 aa9.88□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.88□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.87□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 APOC3P02656 99 aa9.87□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 AMN1Q8IY45 258 aa9.87□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 Q9H8V8 135 aa9.87□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 H7C1H1 209 aa9.86□□□□□ -0.83
RASGEF1B-202ENST00000335927 UBE2D3P61077 147 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms