RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 POLEQ07864 2286 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 A0A0B4J2C4 111 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 GATA3P23771 443 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 ZNF876PQ49A33 203 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 C16orf92Q96LL3 132 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 C20orf173Q96LM9 149 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 SOCS3O14543 225 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 ATP6V0E1O15342 81 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 IGHV3-33P01772 117 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 IGF1P05019 195 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 KIR2DL4Q99706 377 aa8.49□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 APC2O95996 2303 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 J3QQQ9 107 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 VCYO14598 125 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 ECSCRQ19T08 205 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 A0A0J9YX75 114 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 MGPP08493 103 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 Q8NA96 180 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.48□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 MGAQ8IWI9 3026 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 GAGE2BQ13066 116 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 GAGE2EQ4V326 116 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 ACACAQ13085 2346 aa8.47□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 A4D1N5 150 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 C9JAW5 83 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 LEPROTO15243 131 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 IGHV1-69P01742 117 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 SIRPDQ9H106 197 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa8.46□□□□□ -1.05
GINS3-202ENST00000328514 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.46□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 TMEM223A0PJW6 202 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 FAM223BA6NKX1 122 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 SNCGO76070 127 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 ATXN8Q156A1 80 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 Q8N1Y9 231 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 BSNQ9UPA5 3926 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 COL12A1Q99715 3063 aa8.45□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 GAGE12JA6NER3 117 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 G3V318 75 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 LGALS9O00182 355 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 SPRY2O43597 315 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 GAGE7O76087 117 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 GAGE12FP0CL80 117 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 GAGE12GP0CL81 117 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 GAGE12IP0CL82 117 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 EMP1P54849 157 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 GAGE4Q13068 117 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 LINC01620Q4KN68 170 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 ABCA12Q86UK0 2595 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 ABCA4P78363 2273 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 GNRH2O43555 120 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 UBE2E1P51965 193 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 KLLNB2CW77 178 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 B5MCH6 92 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 M0R2P5 195 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 NDUFA4O00483 81 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 IFITM1P13164 125 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 RHOHQ15669 191 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 LINC01560Q8TB33 94 aa8.43□□□□□ -1.06
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