RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 SLC48A1Q6P1K1 146 aa4.94□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 UBE2WQ96B02 151 aa4.94□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa4.94□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 ZNF580Q9UK33 172 aa4.94□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.94□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa4.93□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.93□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 SPINK2P20155 84 aa4.93□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 NPPCP23582 126 aa4.93□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 Q6ZSN1 163 aa4.93□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 Q8N7P7 452 aa4.93□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 DEFB124Q8NES8 71 aa4.93□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 ZNF524Q96C55 264 aa4.93□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 OCR1Q9BZK8 76 aa4.93□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 LINC00597Q9H2U6 94 aa4.93□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 CMC2Q9NRP2 79 aa4.93□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 ABRACLQ9P1F3 81 aa4.93□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 PCSK5Q92824 1860 aa4.93□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 NINQ8N4C6 2090 aa4.92□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa4.92□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 GNRH2O43555 120 aa4.92□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 DSCAMO60469 2012 aa4.92□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 PRR4Q16378 134 aa4.92□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 ORMDL3Q8N138 153 aa4.92□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.92□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 EML5Q05BV3 1969 aa4.92□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa4.92□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.92□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa4.92□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 SYCNQ0VAF6 134 aa4.92□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 FHL1Q13642 323 aa4.92□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 SPANXN1Q5VSR9 72 aa4.92□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.92□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 CACNA1EQ15878 2313 aa4.91□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.91□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 H3BVH4 76 aa4.91□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 IGLV1-40P01703 118 aa4.91□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 Q0VFX4 171 aa4.91□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 ABCA7Q8IZY2 2146 aa4.91□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 TMEM141Q96I45 108 aa4.91□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.91□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 C11orf94C9JXX5 98 aa4.9□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.9□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 RPRMLQ8N4K4 120 aa4.9□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 DYNLRB2Q8TF09 96 aa4.9□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 SMIM7Q9BQ49 75 aa4.9□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa4.9□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
RRN3-202ENST00000327307 IGSF10Q6WRI0 2623 aa4.9□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa4.9□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 A0A1B0GWA3 101 aa4.9□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 IQCF6A8MYZ5 107 aa4.9□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 FAM72CH0Y354 149 aa4.9□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 IGHV3-11P01762 117 aa4.9□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 CCL3P10147 92 aa4.9□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 CAV3P56539 151 aa4.9□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 FXYD7P58549 80 aa4.9□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4.9□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 LY6G5CQ5SRR4 150 aa4.9□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 FAM72DQ6L9T8 149 aa4.9□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.9□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 DEC1Q9P2X7 70 aa4.9□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 KALRNO60229 2985 aa4.9□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa4.9□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 THADAQ6YHU6 1953 aa4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 PCNX2A6NKB5 2137 aa4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 CGB3P0DN86 165 aa4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 CGB7P0DN87 165 aa4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 CASC10Q5T4H9 136 aa4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 PFN4Q8NHR9 129 aa4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 C11orf1Q9H5F2 150 aa4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 GON4LQ3T8J9 2241 aa4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 GTF3C1Q12789 2109 aa4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 DOCK9Q9BZ29 2069 aa4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 A0A0B4J2C4 111 aa4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 Q96M85 177 aa4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 MYO16Q9Y6X6 1858 aa4.89□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 PLXNB1O43157 2135 aa4.88□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 BPTFQ12830 3046 aa4.88□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.88□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 LINC01548A6NM66 108 aa4.88□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 C16orf90A8MZG2 172 aa4.88□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa4.88□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.88□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.88□□□□□ -1.63
RRN3-202ENST00000327307 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms