RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 SYT8Q8NBV8 401 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 XKRY2A2RUG3 117 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 A8MWL6 223 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 NTF3P20783 257 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 CTRLP40313 264 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 TCTAP57738 103 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 P0DMU3 169 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 FAM231AP0DMU4 169 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 FAM231CP0DMU5 169 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 GYPEP15421 78 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 EVI2AP22794 236 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 UQCC3Q6UW78 93 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 RYR2Q92736 4967 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1W2PPQ1 181 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 HIGD1CA8MV81 97 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 F2Z2F3 143 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 H3BNG1 76 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 K7EQD1 137 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00315P59091 139 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 CT83Q5H943 113 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 TSKUQ8WUA8 353 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 CNFNQ9BYD5 112 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 F8W036 122 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 SLAQ13239 276 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 ESRGQ1W209 222 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 TWIST1Q15672 202 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 RNF212Q495C1 297 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 NUP35Q8NFH5 326 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 CACNG7P62955 275 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 AP1S3Q96PC3 154 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 RHODO00212 210 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 CIDEAO60543 219 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF56Q15929 161 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 GAGE12JA6NER3 117 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 MGPP08493 103 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 GAGE1Q13065 139 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 GAGE4Q13068 117 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 GAGE5Q13069 117 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 RHOHQ15669 191 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 GAGE13Q4V321 117 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 WDR73Q6P4I2 378 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 SEC11CQ9BY50 192 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1B0GUT8 65 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 FAM231BA6NCW3 169 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 F5H697 171 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 SRIP30626 198 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 A6NJY4 79 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 SMIM17P0DL12 118 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00694P0DN24 101 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 RAB4BP61018 213 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 M0QY20 66 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 TRGC1P0CF51 173 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 CCL18P55774 89 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 GAS8-AS1O95177 125 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 M0R2N4 97 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 MT-ND4LP03901 98 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 CAMPP49913 170 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 PPP1R2P9O14990 202 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 AMN1Q8IY45 258 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 GATD1Q8NB37 220 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-201ENST00000309641 BORCS7Q96B45 105 aa6.23□□□□□ -1.41
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