RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPN3-201ENST00000262539 DYSFO75923 2080 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPN3-201ENST00000262539 DDTP30046 118 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPN3-201ENST00000262539 AMN1Q8IY45 258 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPN3-201ENST00000262539 DSCR8Q96T75 97 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPN3-201ENST00000262539 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPN3-201ENST00000262539 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 SLURP1P55000 103 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 C20orf78Q9BR46 151 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 CENPFP49454 3210 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 A0A1B0GXF2 115 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 HLA-DRB4P13762 266 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 CDSNQ15517 529 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 RHOHQ15669 191 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF479Q96JC4 524 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 ESM1Q9NQ30 184 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 IGLV2-8P01709 118 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 FSHBP01225 129 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 GAGE2BQ13066 116 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC140Q96MF4 163 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 CNFNQ9BYD5 112 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 PTPRBP23467 1997 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 SOCS3O14543 225 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 INSL3P51460 131 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 RITA1Q96K30 269 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 CEP350Q5VT06 3117 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 TM2D2Q9BX73 214 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 K7EN84 100 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 SPINK8P0C7L1 97 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 GYPEP15421 78 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 HAMPP81172 84 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 DEFB4AO15263 64 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 NDUFA7O95182 113 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 IGLC6P0CF74 106 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 HSD52Q0P140 79 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 Q8N2B8 174 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 ATP5G1P05496 136 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 GTSF1Q8WW33 167 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM141Q96I45 108 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 C16orf74Q96GX8 76 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 PCNTO95613 3336 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 MORN5Q5VZ52 161 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 TDRG1Q3Y452 100 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 hDV102S1A0JD36 115 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 PSMB8P28062 276 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 PYY3Q5JQD4 70 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 NCKAP5O14513 1909 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 DEFB125Q8N687 156 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 K7EQG2 157 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 Q8N8P6 123 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 LINC00479Q96M42 142 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 BLCAPP62952 87 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 DEFB135Q30KP9 77 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM213A2RRL7 107 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPN3-201ENST00000262539 Q6ZWC4 215 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPN3-201ENST00000262539 HERVK_113P63121 156 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPN3-201ENST00000262539 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPN3-201ENST00000262539 HILS1P60008 231 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPN3-201ENST00000262539 UBL5Q9BZL1 73 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPN3-201ENST00000262539 DSCAMO60469 2012 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPN3-201ENST00000262539 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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