RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221770.7

POP4-201, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POP4, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-201ENST00000221770 TMEM89A2RUT3 159 aa11.8□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 J3QLI3 93 aa11.8□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 GNRH2O43555 120 aa11.8□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 HHLA3Q9XRX5 114 aa11.8□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 SMIM2Q9BVW6 85 aa11.8□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 PKD1L2Q7Z442 2459 aa11.79□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa11.79□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 SPRY2O43597 315 aa11.79□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 DPM2O94777 84 aa11.79□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 WIPF1O43516 503 aa11.78□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 EDN2P20800 178 aa11.78□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 DCANP1Q8TF63 244 aa11.78□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 HIGD1BQ9P298 99 aa11.78□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 TGFAP01135 160 aa11.78□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 RASL10AQ92737 203 aa11.78□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 KIR2DL4Q99706 377 aa11.78□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 ZFHX3Q15911 3703 aa11.78□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 A0A096LNT2 108 aa11.77□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 KLLNB2CW77 178 aa11.77□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 ORMDL2Q53FV1 153 aa11.77□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 VCX2Q9H322 139 aa11.77□□□□□ -0.52
POP4-201ENST00000221770 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 K7EMI3 77 aa11.77□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 CARD19Q96LW7 228 aa11.77□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 FAM159AQ6UWV7 190 aa11.76□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 PPP1R17O96001 155 aa11.76□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 MGPP08493 103 aa11.76□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 COX6B1P14854 86 aa11.76□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 CFAP126Q5VTH2 177 aa11.76□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 C10orf99Q6UWK7 81 aa11.76□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 TMEM160Q9NX00 188 aa11.76□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 VPS13CQ709C8 3753 aa11.75□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 CEND1Q8N111 149 aa11.75□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.75□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa11.75□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa11.75□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 GTSCR1Q86UQ5 136 aa11.75□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 SPANXA1Q9NS26 97 aa11.75□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 NXPH4O95158 308 aa11.74□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 POM121L12Q8N7R1 296 aa11.74□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 C12orf74Q32Q52 190 aa11.74□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa11.74□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 TOMM6Q96B49 74 aa11.74□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa11.73□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 IFITM1P13164 125 aa11.73□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 GAGE2BQ13066 116 aa11.73□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 RRN3P1Q2M238 152 aa11.73□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 GAGE2EQ4V326 116 aa11.73□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 SCGB3A1Q96QR1 104 aa11.73□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.73□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 MEIG1Q5JSS6 88 aa11.72□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 PPDPFLQ8WWR9 84 aa11.72□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 ODF3Q96PU9 254 aa11.72□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa11.72□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.72□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 H7C1H1 209 aa11.72□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 ZNF688P0C7X2 276 aa11.72□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 HLA-DRB4P13762 266 aa11.72□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 PLNP26678 52 aa11.72□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 TTC32Q5I0X7 151 aa11.72□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa11.72□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa11.72□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 PRB1P04280 392 aa11.71□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 ELANEP08246 267 aa11.71□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 Q6YL49 198 aa11.71□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.71□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 COL12A1Q99715 3063 aa11.71□□□□□ -0.53
POP4-201ENST00000221770 RNF223E7ERA6 249 aa11.71□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 CD7P09564 240 aa11.71□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 TMEM126AQ9H061 195 aa11.71□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 PIEZO1Q92508 2521 aa11.71□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 A0A0J9YX75 114 aa11.7□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 SMIM9A6NGZ8 99 aa11.7□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 K7EQG2 157 aa11.7□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 LGALS9O00182 355 aa11.7□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 LINC00315P59091 139 aa11.7□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 TTTY13Q9BZ97 58 aa11.7□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 CACNA1AO00555 2505 aa11.7□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 F8VRH5 84 aa11.7□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 SYNJ2BPP57105 145 aa11.7□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 CFAP46Q8IYW2 2715 aa11.7□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 SPG11Q96JI7 2443 aa11.69□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa11.69□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 A0A087WW49 117 aa11.69□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 FSHBP01225 129 aa11.69□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 C2orf66Q6UXQ4 117 aa11.69□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa11.69□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 TMEM262E9PQX1 116 aa11.69□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 IGHV4-31P0DP07 118 aa11.69□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.69□□□□□ -0.54
POP4-201ENST00000221770 UBE2E2Q96LR5 201 aa11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms