RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 VMO1Q7Z5L0 202 aa9.95□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 LAMA5O15230 3695 aa9.94□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 B9A039 149 aa9.94□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.94□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 IGHV3-33P01772 117 aa9.94□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 C20orf173Q96LM9 149 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 DUX3Q96PT4 197 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 TSHBP01222 138 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 IGKV3-20P01619 116 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 FOXC1Q12948 553 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 LRBAP50851 2863 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 NCOR2Q9Y618 2525 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 IGF2RP11717 2491 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 SPXQ9BT56 116 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 CLPSL1A2RUU4 121 aa9.91□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC140Q96MF4 163 aa9.91□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF580Q9UK33 172 aa9.91□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.91□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.91□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 VCYO14598 125 aa9.91□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 PPP1R17O96001 155 aa9.91□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 IGHV3-11P01762 117 aa9.91□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.91□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 CLEC2BQ92478 149 aa9.91□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 A0A0J9YXV3 536 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 CHD8Q9HCK8 2581 aa9.9□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 TRIAP1O43715 76 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 Q6ZSV7 163 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM219Q86XT9 240 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 SORL1Q92673 2214 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 COX6CP09669 75 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 Q8N9W7 124 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 ODF3Q96PU9 254 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 C9orf139Q6ZV77 190 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 GPHB5Q86YW7 130 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 LINC00477Q96M19 166 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 IGIPA6NJ69 53 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 RNF223E7ERA6 249 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 HTN1P15515 57 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM141Q96I45 108 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.87□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 A0A0U1RRA0 63 aa9.87□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.87□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa9.87□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 M0R2P5 195 aa9.87□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 UBE2E1P51965 193 aa9.87□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 FAM110AQ9BQ89 295 aa9.87□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 PIEZO1Q92508 2521 aa9.87□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 LEPROTO15243 131 aa9.86□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.86□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 CREBBPQ92793 2442 aa9.86□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 OVOL1O14753 267 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF876PQ49A33 203 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 LGALS9O00182 355 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 TRBV12-3P01733 135 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 DAND5Q8N907 189 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 MUC4Q99102 2169 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 UBTD1Q9HAC8 227 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.85□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 ATRXP46100 2492 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 A0A0B4J2C4 111 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 NACAE9PAV3 2078 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 A0A0J9YXY3 114 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 ODF3BA8MYP8 253 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 A8MZ25 164 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 LY6G5BQ8NDX9 201 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 TIMM17AQ99595 171 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGA3-201ENST00000007722 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.83□□□□□ -0.84
ITGA3-201ENST00000007722 P0DMU3 169 aa9.83□□□□□ -0.84
ITGA3-201ENST00000007722 FAM231AP0DMU4 169 aa9.83□□□□□ -0.84
ITGA3-201ENST00000007722 FAM231CP0DMU5 169 aa9.83□□□□□ -0.84
ITGA3-201ENST00000007722 CD28P10747 220 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.4 ms