RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622939.3

CU633967.1-209, humanhuman

TSL 3

Gene CU633967.1, Length 589 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633967.1-209ENST00000622939 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa4.95□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 TMEM75Q8N9X5 138 aa4.95□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.95□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 HERC1Q15751 4861 aa4.95□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.94□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.94□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.94□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 DNLZQ5SXM8 178 aa4.94□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 Q8N814 137 aa4.94□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 HIST1H2BAQ96A08 127 aa4.94□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.94□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 BATF3Q9NR55 127 aa4.94□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.94□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 RPH3ALQ9UNE2 315 aa4.94□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.93□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 PGPEP1LA6NFU8 196 aa4.93□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 F6UZH7 168 aa4.93□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 PTTG1O95997 202 aa4.93□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 GNG5P63218 68 aa4.93□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 Q5VSD8 79 aa4.93□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 DPPA3Q6W0C5 159 aa4.93□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 IL36BQ9NZH7 164 aa4.93□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 ZFP30Q9Y2G7 519 aa4.93□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa4.92□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.92□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 GGTLC3B5MD39 225 aa4.92□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 RHODO00212 210 aa4.92□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 GIPP09681 153 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 S100A4P26447 101 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 ASIPP42127 132 aa4.92□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 ZNF506Q5JVG8 444 aa4.92□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.92□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 PRNTQ86SH4 94 aa4.92□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa4.92□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 SYT8Q8NBV8 401 aa4.92□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 LINC00479Q96M42 142 aa4.92□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.92□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 MED28Q9H204 178 aa4.92□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.91□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa4.91□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa4.91□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 IFNA7P01567 189 aa4.91□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 LINC00694P0DN24 101 aa4.91□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 FHITP49789 147 aa4.91□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 ELOBQ15370 118 aa4.91□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 RMI2Q96E14 147 aa4.91□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 SGK494Q96LW2 274 aa4.91□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 PARLQ9H300 379 aa4.91□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 ALG5Q9Y673 324 aa4.91□□□□□ -1.62
CU633967.1-209ENST00000622939 B4DEV8 164 aa4.9□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 KRBOX1C9JBD0 128 aa4.9□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 S100A9P06702 114 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 Q6ZSA8 131 aa4.9□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 Q6ZSN1 163 aa4.9□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 Q8N976 141 aa4.9□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 FMC1Q96HJ9 113 aa4.9□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa4.9□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 RNF222A6NCQ9 220 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 GAGE12JA6NER3 117 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 FAM74A7A6NL05 159 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 PEX7O00628 323 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 IGHV3-30P01768 117 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 IGHV3-33P01772 117 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 ARMS2P0C7Q2 107 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 CRIP1P50238 77 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 Q0VG73 95 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 GAGE1Q13065 139 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 GAGE4Q13068 117 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 GAGE5Q13069 117 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 ZNF674Q2M3X9 581 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 GAGE13Q4V321 117 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 FAM162BQ5T6X4 162 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 DMRTA1Q5VZB9 504 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 STOML3Q8TAV4 291 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 SFRP2Q96HF1 295 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 Q9HAA7 133 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa4.89□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.88□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 CXCL1P09341 107 aa4.88□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 PKIAP61925 76 aa4.88□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 ZNF726P1Q15940 193 aa4.88□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 LINC01559Q495D7 138 aa4.88□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 Q5BKY6 102 aa4.88□□□□□ -1.63
CU633967.1-209ENST00000622939 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.3 ms