RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 LINC01556Q5JQF7 62 aa14.84□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa14.84□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 Q6ZSN1 163 aa14.84□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 PRNTQ86SH4 94 aa14.84□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa14.83□□□□□ -0.04
SRRT-218ENST00000620394 PPT1P50897 306 aa14.83□□□□□ -0.04
SRRT-218ENST00000620394 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.83□□□□□ -0.04
SRRT-218ENST00000620394 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa14.82□□□□□ -0.04
SRRT-218ENST00000620394 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.82□□□□□ -0.04
SRRT-218ENST00000620394 FAM229AH3BQW9 127 aa14.82□□□□□ -0.04
SRRT-218ENST00000620394 PRADC1Q9BSG0 188 aa14.82□□□□□ -0.04
SRRT-218ENST00000620394 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.82□□□□□ -0.04
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SRRT-218ENST00000620394 PGPEP1LA6NFU8 196 aa14.81□□□□□ -0.04
SRRT-218ENST00000620394 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SRRT-218ENST00000620394 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa14.81□□□□□ -0.04
SRRT-218ENST00000620394 G3V3Q6 166 aa14.8□□□□□ -0.04
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SRRT-218ENST00000620394 GCSHP23434 173 aa14.79□□□□□ -0.04
SRRT-218ENST00000620394 Q86TA4 180 aa14.79□□□□□ -0.04
SRRT-218ENST00000620394 OR2T35Q8NGX2 323 aa14.79□□□□□ -0.04
SRRT-218ENST00000620394 LINC00479Q96M42 142 aa14.79□□□□□ -0.04
SRRT-218ENST00000620394 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.78□□□□□ -0.04
SRRT-218ENST00000620394 LINC00694P0DN24 101 aa14.78□□□□□ -0.04
SRRT-218ENST00000620394 LELP1Q5T871 98 aa14.78□□□□□ -0.04
SRRT-218ENST00000620394 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SRRT-218ENST00000620394 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa14.77□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa14.77□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 FAM74A7A6NL05 159 aa14.77□□□□□ -0.05
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SRRT-218ENST00000620394 PEX7O00628 323 aa14.77□□□□□ -0.05
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SRRT-218ENST00000620394 PARLQ9H300 379 aa14.77□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 A8MWV9 139 aa14.76□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 UBE2G2P60604 165 aa14.76□□□□□ -0.05
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SRRT-218ENST00000620394 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.76□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 GTSF1LQ9H1H1 148 aa14.76□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 LRCOL1A6NCL2 159 aa14.75□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 FABP5P3A8MUU1 101 aa14.75□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 IFNA7P01567 189 aa14.75□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 OR10J3Q5JRS4 329 aa14.75□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 DNLZQ5SXM8 178 aa14.75□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.75□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 TMEM70Q9BUB7 260 aa14.75□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 IL36BQ9NZH7 164 aa14.75□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 ASIPP42127 132 aa14.74□□□□□ -0.05
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SRRT-218ENST00000620394 UFSP1Q6NVU6 142 aa14.74□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.74□□□□□ -0.05
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SRRT-218ENST00000620394 LAGE3Q14657 143 aa14.73□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.73□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.72□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 HAMPP81172 84 aa14.72□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa14.72□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.72□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 PSCAO43653 123 aa14.71□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 CRIP1P50238 77 aa14.71□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.71□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 ZFP30Q9Y2G7 519 aa14.71□□□□□ -0.05
SRRT-218ENST00000620394 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa14.7□□□□□ -0.06
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SRRT-218ENST00000620394 KRBOX1C9JBD0 128 aa14.7□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 H3BVH4 76 aa14.7□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 ARPC5O15511 151 aa14.7□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 FHITP49789 147 aa14.7□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 FMC1Q96HJ9 113 aa14.7□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa14.69□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 IGHV3-30P01768 117 aa14.69□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 IGHV3-33P01772 117 aa14.69□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa14.69□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa14.69□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 RGS21Q2M5E4 152 aa14.69□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 RHODO00212 210 aa14.68□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 SH2D1AO60880 128 aa14.68□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 FAM162BQ5T6X4 162 aa14.68□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 SAMD10Q9BYL1 202 aa14.68□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 JPT2Q9H910 190 aa14.68□□□□□ -0.06
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SRRT-218ENST00000620394 GAGE12JA6NER3 117 aa14.67□□□□□ -0.06
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SRRT-218ENST00000620394 GAGE5Q13069 117 aa14.67□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 ZNF674Q2M3X9 581 aa14.67□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 LINC01559Q495D7 138 aa14.67□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 GAGE13Q4V321 117 aa14.67□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.67□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 Q8N814 137 aa14.67□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 SYT8Q8NBV8 401 aa14.67□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 Q9UF83 564 aa14.67□□□□□ -0.06
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