RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 S100A4P26447 101 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GNRH2O43555 120 aa16.38■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 J3QLI3 93 aa16.38■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FABP2P12104 132 aa16.38■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NRACQ8N912 160 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM158Q8WZ71 300 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM19A4Q96LR4 140 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PTPN13Q12923 2485 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHV4-31P0DP07 118 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ASIPP42127 132 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SAMD5Q5TGI4 173 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DUX5Q96PT3 197 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 K7EMT4 169 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GCSHP23434 173 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FCER1GP30273 86 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMIM13P0DJ93 91 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DCANP1Q8TF63 244 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TTTY13Q9BZ97 58 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 VPREB3Q9UKI3 123 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FXYD2P54710 66 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RPL24P83731 157 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 Q8N8P6 123 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCA12Q86UK0 2595 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LINC01546A6NGU7 62 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF688P0C7X2 276 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SYNJ2BPP57105 145 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF580Q9UK33 172 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa16.33■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 K7ERJ3 54 aa16.33■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGKV3-20P01619 116 aa16.33■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ID1P41134 155 aa16.33■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 Q5PR19 223 aa16.33■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa16.32■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRSS1P07477 247 aa16.32■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMIM17P0DL12 118 aa16.32■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MXRA5Q9NR99 2828 aa16.32■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PSMG4Q5JS54 123 aa16.31■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 Q6YL49 198 aa16.31■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NAV2Q8IVL1 2488 aa16.31■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MGPP08493 103 aa16.31■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF702PQ9H963 129 aa16.31■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa16.3■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A087WW49 117 aa16.3■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DEFB113Q30KQ7 82 aa16.3■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SAMD13Q5VXD3 122 aa16.3■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHAC1Q9BUX1 264 aa16.29■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa16.29■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FSHBP01225 129 aa16.29■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 APRG1Q8IVJ8 170 aa16.29■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 Q96MF0 132 aa16.29■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CIDEAO60543 219 aa16.28■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LAGE3Q14657 143 aa16.28■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MRAP2Q96G30 205 aa16.28■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FOXC2Q99958 501 aa16.28■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EPG5Q9HCE0 2579 aa16.28■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ODF1Q14990 250 aa16.28■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KLLNB2CW77 178 aa16.27■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 K7EMI3 77 aa16.27■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HHLA3Q9XRX5 114 aa16.27■□□□□ 0.2
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa16.27■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RASL10AQ92737 203 aa16.27■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DPH3P1Q9H4G8 78 aa16.27■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM159AQ6UWV7 190 aa16.26■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C18orf65Q6ZTR6 163 aa16.26■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HIGD1BQ9P298 99 aa16.26■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM89A2RUT3 159 aa16.26■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DEFB136Q30KP8 78 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GTSCR1Q86UQ5 136 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMIM2Q9BVW6 85 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GTSF1LQ9H1H1 148 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZMAT4Q9H898 229 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRSS47A8MTI9 375 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGKCP01834 107 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TEX15Q9BXT5 2789 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ELANEP08246 267 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CD7P09564 240 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AZU1P20160 251 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 JPT2Q9H910 190 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYOZ3Q8TDC0 251 aa16.23■□□□□ 0.19
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