RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.46□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.46□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 KALRNO60229 2985 aa7.46□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 LYNX1G3V0Z9 82 aa7.45□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 LYNX1P0DP58 116 aa7.45□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 KLK15Q9H2R5 256 aa7.45□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.45□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.45□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.45□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.45□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.45□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.45□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 IGHV1-69P01742 117 aa7.45□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.45□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 ODF3Q96PU9 254 aa7.45□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.44□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 LEPROTO15243 131 aa7.44□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.44□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 TMEM223A0PJW6 202 aa7.44□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 CLEC3BP05452 202 aa7.44□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.44□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 METTL26Q96S19 204 aa7.44□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.44□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.44□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.44□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 IGF1P05019 195 aa7.44□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 HES1Q14469 280 aa7.44□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 M0R2P5 195 aa7.43□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 OVOL1O14753 267 aa7.43□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.43□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.43□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.43□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.43□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 J3QQQ9 107 aa7.43□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 CRLF1O75462 422 aa7.43□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 Q8N1Y9 231 aa7.43□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.43□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.42□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 SFTA2Q6UW10 78 aa7.42□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 MDFICQ9P1T7 246 aa7.42□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 A4D1N5 150 aa7.42□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 LGALS9O00182 355 aa7.42□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 CD3EP07766 207 aa7.42□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 ATXN8Q156A1 80 aa7.42□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.42□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 RAX2Q96IS3 184 aa7.42□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.42□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.42□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 LINC01620Q4KN68 170 aa7.42□□□□□ -1.22
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HCG18-242ENST00000602319 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
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HCG18-242ENST00000602319 IFITM1P13164 125 aa7.41□□□□□ -1.22
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HCG18-242ENST00000602319 GAGE2EQ4V326 116 aa7.41□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 LITAFQ99732 161 aa7.41□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.41□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.41□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.41□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 GAGE12JA6NER3 117 aa7.41□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 GAGE7O76087 117 aa7.41□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 ELANEP08246 267 aa7.41□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 GAGE12FP0CL80 117 aa7.41□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 GAGE12GP0CL81 117 aa7.41□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 GAGE12IP0CL82 117 aa7.41□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 GAGE4Q13068 117 aa7.41□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 SIRPDQ9H106 197 aa7.41□□□□□ -1.22
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HCG18-242ENST00000602319 B5MCH6 92 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 CCDC179H3BU77 68 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 VCYO14598 125 aa7.4□□□□□ -1.22
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HCG18-242ENST00000602319 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 MGPP08493 103 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 RHOHQ15669 191 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 C16orf92Q96LL3 132 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG18-242ENST00000602319 MUC4Q99102 2169 aa7.4□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 KLLNB2CW77 178 aa7.4□□□□□ -1.23
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HCG18-242ENST00000602319 CFAP161Q6P656 301 aa7.4□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 Q8NA96 180 aa7.4□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 BRI3O95415 125 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 ICE1Q9Y2F5 2266 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-242ENST00000602319 FAM223BA6NKX1 122 aa7.39□□□□□ -1.23
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