RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587743.1

SNHG16-205, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, human

Gene SNHG16, Length 2,665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG16-205	ENST00000587743	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	RAX	Q9Y2V3	346 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743		F8W1H4	67 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	SRD5A1	P18405	259 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	AZU1	P20160	251 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	INSL3	P51460	131 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	SCGB2A2	Q13296	93 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	LINC00477	Q96M19	166 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	SOCS3	O14543	225 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF815P	A8K554	130 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	C20orf78	Q9BR46	151 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	JPT2	Q9H910	190 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG16-205	ENST00000587743	SLC25A16	P16260	332 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	EDN2	P20800	178 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	LY6E	Q16553	131 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	KLRB1	Q12918	225 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	GAGE13	Q4V321	117 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	PRO0461	Q9UI25	63 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM223B	A6NKX1	122 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743		A0A1B0GWB2	263 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	CRYGD	P07320	174 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	OVOL1	O14753	267 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	TSHB	P01222	138 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	SIGMAR1	Q99720	223 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	LINC01549	A6NIU2	74 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743		Q6ZS46	218 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743		A0A087WWL8	130 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	C11orf86	A6NJI1	115 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	NDUFA4	O00483	81 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	COX6B1	P14854	86 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	SPG11	Q96JI7	2443 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5	6e-10	■■■□□ 18.6
SNHG16-205	ENST00000587743	APOM	O95445	188 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	PF4V1	P10720	104 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	LINC00315	P59091	139 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	LINC01619	G3V211	115 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	BLCAP	P62952	87 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG16-205	ENST00000587743	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743		F5H697	171 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743		J3QR89	54 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	C19orf84	I3L1E1	186 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	TSPAN13	O95857	204 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	IGHV1-69	P01742	117 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	SORL1	Q92673	2214 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	IGIP	A6NJ69	53 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	PSMB2	P49721	201 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743		H3BUX3	64 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	UBE2D1	P51668	147 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	SPATA25	Q9BR10	227 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	NDUFS8	O00217	210 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	IGHV4-39	P01824	125 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	CD7	P09564	240 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
SNHG16-205	ENST00000587743	PTH2	Q96A98	100 aa		11.86	□□□□□ -0.51

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