RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169		A0A087WWC5	75 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	MBD2	Q9UBB5	411 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	GAGE12J	A6NER3	117 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	IGLV2-11	P01706	119 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	GAGE1	Q13065	139 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	GAGE4	Q13068	117 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	GAGE5	Q13069	117 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	GAGE13	Q4V321	117 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	PARL	Q9H300	379 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169		Q9UF83	564 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TCF4-238	ENST00000568169	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169		H0YIZ8	118 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	TAAR5	O14804	337 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	SEC11B	P0C7V7	166 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	GNG5	P63218	68 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	NIT1	Q86X76	327 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169		A8MWV9	139 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	MT1HL1	P0DM35	61 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	ATRAID	Q6UW56	229 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	SGK494	Q96LW2	274 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	LINC00479	Q96M42	142 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	KLK12	Q9UKR0	248 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	SIX6	O95475	246 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	GCG	P01275	180 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	UBE2W	Q96B02	151 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	C14orf177	Q52M58	125 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	HSPB11	Q9Y547	144 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169		A0A1W2PPV4	95 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	TCRA	P04437	139 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	ELOB	Q15370	118 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	SMUG1	Q53HV7	270 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	JPT2	Q9H910	190 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	PSG8	Q9UQ74	426 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169		K7EQM0	130 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	RAB2A	P61019	212 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169		Q0VG73	95 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-238	ENST00000568169		A0A087WX48	190 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	ZFP69	Q49AA0	526 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	PRNT	Q86SH4	94 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC32	Q9BV29	185 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	IL36B	Q9NZH7	164 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	RHOD	O00212	210 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	ENHO	Q6UWT2	76 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169		Q6ZRU5	148 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	SUN5	Q8TC36	379 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	WFDC1	Q9HC57	220 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	USP17L23	D6RBM5	183 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	MPC2	O95563	127 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	ASIP	P42127	132 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	H2BFS	P57053	126 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-238	ENST00000568169	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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