RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 TOMM6Q96B49 74 aa2.61□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 IFI27L1Q96BM0 104 aa2.61□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 FAM3DQ96BQ1 224 aa2.61□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 ABHD14BQ96IU4 210 aa2.61□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 LINC00167Q96N53 147 aa2.61□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 TXNDC17Q9BRA2 123 aa2.61□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 SLC25A2Q9BXI2 301 aa2.61□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 DEFB126Q9BYW3 111 aa2.61□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 C2orf16Q68DN1 1984 aa2.61□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 PTPRSQ13332 1948 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 PCDH15Q96QU1 1955 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 H0Y9J4 135 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 H3BMM0 161 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 H7BZZ5 65 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 J3QLW9 94 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 COX7A2LO14548 114 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 RBMY1CP0DJD4 496 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 UBE2D1P51668 147 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 DYNLT3P51808 116 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 MP68P56378 58 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 ADIGQ0VDE8 80 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 KISS1Q15726 138 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 C1orf100Q5SVJ3 147 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 PDPNQ86YL7 162 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 GPHB5Q86YW7 130 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 GVQW1Q8N7I0 195 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 C11orf72Q8NBR9 251 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 UBE2WQ96B02 151 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 RNF185Q96GF1 192 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 TIMM17AQ99595 171 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 SLC50A1Q9BRV3 221 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 Q9HAA7 133 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 PROK2Q9HC23 129 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 OSTCQ9NRP0 149 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 PLXNA3P51805 1871 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 EML6Q6ZMW3 1958 aa2.6□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 A0A0B4J2C4 111 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 C9JCJ5 164 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 H3BVH4 76 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 PEX7O00628 323 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 IGKV1-5P01602 117 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 IGKV1-13P0DP09 117 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 MGST1P10620 155 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 PRR3P79522 188 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 GDF5OSQ5U4N7 250 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 PRNTQ86SH4 94 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 NDUFA11Q86Y39 141 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 FAM223AQ8IWN6 122 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 VSIG2Q96IQ7 327 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 CCL13Q99616 98 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 TIMM9Q9Y5J7 89 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 GREB1Q4ZG55 1949 aa2.59□□□□□ -1.99
GDE1-202ENST00000563645 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 UBR3Q6ZT12 1888 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 DYSFO75923 2080 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 LINC01549A6NIU2 74 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 FAM223BA6NKX1 122 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 A6NN06 94 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 BCE1O60756 84 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 LTAP01374 205 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IL9P15248 144 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 XCL1P47992 114 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 CCL23P55773 120 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 UBE2BP63146 152 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 RPL38P63173 70 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 RBM3P98179 157 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 C2orf83Q53S99 150 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 MDP1Q86V88 176 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 ARL17AQ8IVW1 177 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 WFDC5Q8TCV5 224 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 SMCR5Q8TEV8 140 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 ZNF714Q96N38 554 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 ESM1Q9NQ30 184 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 XCL2Q9UBD3 114 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 LCTP09848 1927 aa2.58□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa2.57□□□□□ -2
GDE1-202ENST00000563645 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms