RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563032.1

TCF25-208, Transcript of transcription factor 25, human

TSL 2

Gene TCF25, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF25-208	ENST00000563032	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-208	ENST00000563032	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	PEX7	O00628	323 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	UBE2G2	P60604	165 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	ZNF726P1	Q15940	193 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	RGS21	Q2M5E4	152 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032		A8MWV9	139 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	ASIP	P42127	132 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	LINC00479	Q96M42	142 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	STOML3	Q8TAV4	291 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	FAM74A7	A6NL05	159 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	PSCA	O43653	123 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	LELP1	Q5T871	98 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	ARPC5	O15511	151 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032		Q86TA4	180 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032		B4DEV8	164 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	UBE2G1	P62253	170 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	SYT8	Q8NBV8	401 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	FMC1	Q96HJ9	113 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	PARL	Q9H300	379 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	IL36B	Q9NZH7	164 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	FHIT	P49789	147 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF25-208	ENST00000563032	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032		G3V3Q6	166 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	RHOD	O00212	210 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	CST9LP1	Q5W188	147 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032		H3BVH4	76 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032		M0R036	132 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	SH2D1A	O60880	128 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	IGHV3-30	P01768	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	IGHV3-33	P01772	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	GCSH	P23434	173 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	TM2D2	Q9BX73	214 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032		Q9HAA7	133 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032		A0A087WWC5	75 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	GAGE12J	A6NER3	117 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	EPM2A	B3EWF7	344 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	CRIP1	P50238	77 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	GAGE1	Q13065	139 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	GAGE4	Q13068	117 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	GAGE5	Q13069	117 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	ZNF345	Q14585	488 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	LAGE3	Q14657	143 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	GAGE13	Q4V321	117 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032		Q6ZSN1	163 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	UMAD1	C9J7I0	102 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	AKR1C3	P42330	323 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TCF25-208	ENST00000563032	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF25-208	ENST00000563032	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF25-208	ENST00000563032	LTA	P01374	205 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF25-208	ENST00000563032	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TCF25-208	ENST00000563032	SEC11B	P0C7V7	166 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF25-208	ENST00000563032	KRTAP10-1	P60331	282 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF25-208	ENST00000563032	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF25-208	ENST00000563032	TOR2A	Q5JU69	321 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF25-208	ENST00000563032	JPT2	Q9H910	190 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF25-208	ENST00000563032	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF25-208	ENST00000563032	LINC01559	Q495D7	138 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF25-208	ENST00000563032	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF25-208	ENST00000563032	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF25-208	ENST00000563032	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		13.63	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms