RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561204.5

MEIS3-211, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEIS3, Length 2,195 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-211ENST00000561204 MUC4Q99102 2169 aa13.05□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 GAGE10A6NGK3 116 aa13.05□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV4-59P01825 116 aa13.05□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 UFSP1Q6NVU6 142 aa13.05□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 RAB37Q96AX2 223 aa13.05□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 TOMM6Q96B49 74 aa13.05□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 AP1S3Q96PC3 154 aa13.05□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF580Q9UK33 172 aa13.05□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 IGSF10Q6WRI0 2623 aa13.05□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 GAGE12BA1L429 117 aa13.04□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 NXPH4O95158 308 aa13.04□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 FXYD2P54710 66 aa13.04□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 C10orf99Q6UWK7 81 aa13.04□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa13.04□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 CSPG4Q6UVK1 2322 aa13.04□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa13.04□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 GCSHP23434 173 aa13.04□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 PLNP26678 52 aa13.04□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 DEFB112Q30KQ8 113 aa13.04□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 POM121L12Q8N7R1 296 aa13.04□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 SCGB3A1Q96QR1 104 aa13.04□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 SLC25A16P16260 332 aa13.03□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 WFDC12Q8WWY7 111 aa13.03□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa13.03□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 F8VRH5 84 aa13.03□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 K7EMI3 77 aa13.03□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 ID1P41134 155 aa13.03□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 LINC00315P59091 139 aa13.03□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 CACNA1AO00555 2505 aa13.02□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 CSMD2Q7Z408 3487 aa13.02□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 H7C1H1 209 aa13.02□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 GATA3P23771 443 aa13.02□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 CDKN1BP46527 198 aa13.02□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa13.02□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 K7EP34 96 aa13.01□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 OCIAD2Q56VL3 154 aa13.01□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 FAM159AQ6UWV7 190 aa13.01□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa13.01□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 DSCR9P59020 149 aa13□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 C2orf66Q6UXQ4 117 aa13□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 CSTL1Q9H114 145 aa13□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 SMIM13P0DJ93 91 aa13□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 TM2D2Q9BX73 214 aa13□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 JPT2Q9H910 190 aa13□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa12.99□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 A0A1W2PPM0 123 aa12.99□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 PPP1R17O96001 155 aa12.99□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 SAMD13Q5VXD3 122 aa12.99□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 NEGR1Q7Z3B1 354 aa12.99□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 CEND1Q8N111 149 aa12.99□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 LINC01356Q8N9X3 169 aa12.98□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 BAALCQ8WXS3 180 aa12.98□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa12.98□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 A0A087WW49 117 aa12.98□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 A0A096LNT2 108 aa12.98□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 K7ERJ3 54 aa12.98□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF688P0C7X2 276 aa12.98□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 RNF151Q2KHN1 245 aa12.98□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 CD7P09564 240 aa12.97□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 SUMO4Q6EEV6 95 aa12.96□□□□□ -0.33
MEIS3-211ENST00000561204 A0A087WWL8 130 aa12.96□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM89A2RUT3 159 aa12.96□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 PRSS29PA6NIE9 313 aa12.96□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 SAMD5Q5TGI4 173 aa12.96□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa12.96□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 SPCS1Q9Y6A9 102 aa12.96□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 A0A0J9YX75 114 aa12.95□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 RPL32P62910 135 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 ODF3Q96PU9 254 aa12.95□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 ZANQ9Y493 2812 aa12.95□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa12.94□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 K7EQG2 157 aa12.94□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 IGKV3-20P01619 116 aa12.94□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 PCP4P48539 62 aa12.94□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa12.94□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 TGFAP01135 160 aa12.94□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 FABP2P12104 132 aa12.94□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 SYNJ2BPP57105 145 aa12.94□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 TAL2Q16559 108 aa12.94□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa12.94□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 FBN2P35556 2912 aa12.94□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 MYO18BQ8IUG5 2567 aa12.94□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 OR11H12B2RN74 326 aa12.93□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 TSHBP01222 138 aa12.93□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 OR11H1Q8NG94 326 aa12.93□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 OR11H2Q8NH07 326 aa12.93□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 C9orf85Q96MD7 179 aa12.93□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 MDFICQ9P1T7 246 aa12.93□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 AGRNO00468 2067 aa12.93□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa12.93□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 J3QLI3 93 aa12.93□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 ZFP2Q6ZN57 461 aa12.93□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
MEIS3-211ENST00000561204 F5H697 171 aa12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms